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Santé
Surveillance des maladies
Surveillance de la COVID-19
COVID-19 Agrégé

Surveillance du COVID-19 - Guide de conception d'un système agrégé

Objectif

Le document sur la conception du système agrégé de surveillance du COVID-19 fournit une vue d'ensemble des principes de conception et des conseils utilisés pour développer le package de données numériques pour la surveillance agrégée du COVID-19. Ce document est destiné aux chargés de la mise en œuvre de DHIS2 au niveau national et régional, afin qu'ils puissent soutenir la mise en œuvre et la localisation de l'ensemble de données. Le package de métadonnées COVID-19 peut être adapté aux besoins locaux et aux directives nationales. En particulier, les flux de travail locaux et les directives nationales doivent être pris en compte lors de la localisation et de l'adoption des programmes inclus dans ce package.

Contexte

Ce modèle d'agrégat a été mis à jour pour refléter les nouvelles exigences en matière de notification d'agrégats du document [ Surveillance mondiale de la COVID-19 : Processus de l'OMS pour la notification de données agrégées ] (https://www.who.int/publications/i/item/aggregated-weekly-reporting-form), dont la dernière mise à jour date du 7 août 2020. Le package de données numériques COVID-19 a été développé en réponse au besoin exprimé par les pays d'adapter rapidement une solution pour la gestion des données de la COVID-19. L'UIO a développé des kits de surveillance de la COVID-19 pour trois types de modèles de données (tracker, agrégat basé sur les événements) afin de permettre aux pays de sélectionner le modèle le plus approprié à leur contexte en fonction de la charge de morbidité et des ressources disponibles. Ces modèles ainsi que leurs avantages/limites relatifs sont résumés ci-dessous :

Type de Package de surveillance Surveillance basée sur les cas (Tracker) Liste de lignes de surveillance des cas (événement) Surveillance des cas (Agrégat )
Description Permet d'enregistrer un cas et de le suivre dans le temps grâce à la confirmation en laboratoire et au résultat relatif au cas Permet de saisir les détails relatifs à un cas critique sous forme de liste de lignes Permet la déclaration hebdomadaire des principaux points de données agrégées
Avantages La grande granularité des données et les multiples dimensions temporelles de l'analyse peuvent permettre de décentraliser le flux de travail c'est-à-dire tous les événements liés au cas. Caractéristique plus granulaire qu'agrégée et pouvant saisir les principales dimensions temporelles (c'est-à-dire la date du rapport par rapport à l'apparition des symptômes) ; réduction de la charge de saisie des données par rapport au tracker et niveau de complexité peu élevé Peu complexe, facile à mettre en œuvre, plus facile à gérer lorsque le nombre de cas est élevé
Inconvénients Le volume de données à saisir peut être écrasant lorsque le nombre de cas atteint le seuil ; ceci peut rendre la mise en œuvre complexe Ne prend pas en charge le suivi des cas ou d'autres flux de travail décentralisés Une granularité plus faible pour l'analyse détaillée (c'est-à-dire une analyse basée exclusivement sur la date de notification du cas, une désagrégation limitée)

Ce document ne couvre que la conception de l'ensemble des données agrégées ; des documents de conception de système distincts sont disponibles pour les ensembles Tracker et Liste de ligne (basée sur les événements) de DHIS2. Lorsque le nombre de cas augmente rapidement, certains pays peuvent avoir du mal à établir des rapports basés sur les cas, car la charge de travail devient trop importante. L'ensemble des données est conçu pour répondre aux exigences les plus critiques en matière de déclaration et de capacités d'analyse pour la surveillance et la réponse.

Les objectifs du progiciel de surveillance du COVID-19 sont les suivants :

  1. surveiller les tendances de la maladie là où il y a transmission interhumaine ;
  2. détecter rapidement les nouveaux cas dans les pays où il n'y a pas de circulation du virus ;
  3. fournir des informations épidémiologiques pour effectuer des évaluations des risques aux niveaux national, régional et mondial ; et
  4. fournir des informations épidémiologiques pour orienter les mesures de préparation et d'intervention.

La conception du système s'appuie sur les principes existants de surveillance des maladies et les exigences du système d'information élaborés conjointement par l'OMS et l'UiO depuis 2017. Le progiciel de surveillance de COVID-19 a été développé dans l'intention de s'aligner sur les [directives techniques de l'OMS en matière de surveillance du nCoV-19 et les définitions de cas] (https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/surveillance-and-case-definitions), mises à jour le 07 août 2020. Il convient de noter que cette conception ne reflète pas nécessairement les dernières directives mondiales provisoires disponibles élaborées par l'OMS, étant donné que les mises à jour peuvent être publiées rapidement. Les directives et les politiques nationales peuvent varier et il est donc recommandé d'adapter ce progiciel au contexte local.

Résumé de la conception du système

Lors du développement de ce package de configuration, nous avons essayé de respecter les [principes généraux de conception] de l'UiO's (https://docs.dhis2.org/en/topics/metadata/dhis2-who-digital-health-data-toolkit/general-design-principles-for-who-metadata-packages.html)et une [convention d'appellation] commune(https://docs.dhis2.org/en/topics/metadata/dhis2-who-digital-health-data-toolkit/naming-conventions.html).

Le package global de surveillance agrégé du COVID-19 comprend

  1. Un ensemble de données agrégées hebdomadaires et des éléments de données pour la déclaration de la surveillance du COVID-19
  2. Catégories de désagrégation des données
  3. Indicateurs de base
  4. Tableau de bord et ses items

L'ensemble de données saisit un nombre minimum de points de données qui correspondent aux exigences actuelles de l'OMS en matière de rapports hebdomadaires et génère un ensemble d'indicateurs et de tableaux de bord permettant aux décideurs nationaux et infranationaux d'analyser rapidement les tendances de la maladie et d'y répondre.

Nom. Périodicité Objectif
Surveillance hebdomadaire agrégée Hebdomadaire Déclaration des principales données de surveillance du COVID-19, notamment les cas, les tests et les décès.

Il est recommandé que l'ensemble de données hebdomadaire soit attribué aux unités d'organisation au niveau le plus bas du système de santé où il est possible de déclarer des données, comme les établissements de santé.

Les packages de données numériques sont optimisés pour la collecte de données Android grâce à l'application DHIS2 Capture, téléchargeable gratuitement sur GooglePlay store.

Utilisateurs cibles

  • Les utilisateurs dans les établissements de santé : saisissent et communiquent des données principales sur les cas de COVID-19 et les décès qui se présentent dans les établissements de santé
  • Les agents de surveillance : les agents de surveillance au niveau national et infranational peuvent être chargés d'aider à saisir et à analyser les données.
  • Autorités sanitaires nationales et locales : suivi et analyse des données de surveillance des maladies au moyen de tableaux de bord et d'outils d'analyse permettant de réaliser des évaluations des risques et de planifier les interventions ; production de rapports en vue des rapports régionaux et global

Ensembles de données

Cet ensemble de données est destiné à recueillir les données hebdomadaires nécessaires à une réponse rapide à la transmission de la maladie. Si la charge de travail devient trop importante ou si le pays n'est plus considéré comme une situation d'urgence, l'ensemble de données peut être modifié pour devenir mensuel, conformément aux politiques du ministère de la santé.

Éléments de données de la Surveillance Quotidienne

Les éléments de données et la désagrégation (combinaisons de catégories) inclus dans l'ensemble de données sont énumérés ci-dessous :

Éléments de données les combinaisons de catégories
Nouveaux cas confirmés Sexe (homme/femme/inconnu) et âge (0-4,5-9,10-14,15-19,20-29,30-39,40-49,50-59,60-64,65-69,70-74,75-79,80+,âge inconnu)
Nouveaux cas présumés Sexe (homme/femme/inconnu) et âge (0-4,5-9,10-14,15-19,20-29,30-39,40-49,50-59,60-64,65-69,70-74,75-79,80+,âge inconnu)
Nouveaux décès confirmés Sexe (homme/femme/inconnu) et âge (0-4,5-9,10-14,15-19,20-29,30-39,40-49,50-59,60-64,65-69,70-74,75-79,80+,âge inconnu)
Nouveaux décès présumés Sexe (homme/femme/inconnu) et âge (0-4,5-9,10-14,15-19,20-29,30-39,40-49,50-59,60-64,65-69,70-74,75-79,80+,âge inconnu)
Nouveaux cas hospitalisés Aucun
Nouveaux cas libérés Aucun
Nouveaux Cas parmi les Agents de Santé (Confirmés + Présumés) Aucun
Nouveaux décès parmi les Agents de Santé (Confirmés + Présumés) Aucun
Nombre de personnes ayant subi un test de dépistage du COVID-19 Aucun
Nombre de personnes testées par PCR Aucun
Classification de la transmission Aucun

Formulaire de Saisie des Données de Surveillance Hebdomadaire

  • Section 1: Nouveaux cas confirmés et présumés

Les données doivent être saisies pour tous les nouveaux cas confirmés et présumés signalés au cours de la période de déclaration. Les cas confirmés sont des cas confirmés en laboratoire selon les directives de l'OMS ; les cas présumés sont définis par l'OMS comme des cas où les résultats des tests de laboratoire ne sont pas concluants ; toutefois, les pays peuvent appliquer leurs propres définitions de cas. La colonne « total » est automatiquement additionnée lors de la saisie des données.

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  • Section 2: Nouveaux décès confirmés et présumés

Les données doivent être saisies pour les nouveaux décès confirmés et présumés signalés au cours de la période de déclaration. La colonne « total » est automatiquement additionnée lors de la saisie des données.

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  • Section 3: Infection et décès des agents de santé

Cette section contient des données sur les nouveaux cas confirmés et présumés des agents de santé, notamment les décès notifiés au cours de la période de déclaration.

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  • Section 4: Hospitalisation et sorties

Cette section saisit les données relatives aux nouvelles hospitalisations et aux sorties au cours de la période de déclaration.

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  • Section 5: Tests effectués

Cette section saisit les données relatives aux tests effectués avec une exigence supplémentaire de déclaration des tests effectués par PCR au cours de la période de déclaration.

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  • Section 6: Classification de la transmission

Cette section résume les principales formes de classification des transmissions subies par l'unité de déclaration.

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Personnalisation des formulaires de saisie de données

L'ensemble de données de ce package ne contient pas de formulaire personnalisé. Pour améliorer la convivialité du formulaire pour la saisie des données, les chargés de la mise en œuvre peuvent concevoir un formulaire personnalisé répondant à leurs besoins en suivant le manuel de l'utilisateur de DHIS2 : [https://docs.dhis2.org/2.33/en/user/html/dhis2_user_manual_en_full.html#manage_customform] (https://docs.dhis2.org/en/use/user-guides/dhis-core-version-master/configuring-the-system/metadata.html#manage_customform)

Validation des données

Les règles de validation des données suivantes ont été configurées. Ces règles de validation ne s'appliquent pas au formulaire de saisie des données lui-même, car on s'attend à ce que les données soient communiquées d'urgence lorsque des événements se produisent dans des délais différents (par exemple, au cours d'une semaine, il peut n'y avoir que 3 nouveaux cas, mais 5 décès).

Nom. Opérateur Instruction description du côté gauche description du côté droit
COVID19 - tests PCR \<= testé inférieur _à_ou_égal_à Le nombre de tests PCR doit être inférieur ou égal au nombre total de tests effectués. Testé par PCR Test effectué
COVID19 - Nouveaux cas hospitalisés \<= Tous les nouveaux cas inférieur _à_ou_égal_à Les nouveaux cas hospitalisés devraient être inférieurs ou égaux à tous les nouveaux cas. Nouveaux cas hospitalisés Tous les nouveaux cas
COVID19 - Nouveaux décès confirmés \<= Nouveaux cas confirmés inférieur _à_ou_égal_à Les nouveaux décès confirmés doivent être inférieurs ou égaux aux Nouveaux cas confirmés Nouveaux décès confirmés Nouveaux cas confirmés
COVID19 - Décès présumés \<= Nouveaux cas présumés inférieur _à_ou_égal_à Les nouveaux décès présumés doivent être inférieurs ou égaux aux Nouveaux cas présumés Décès présumés Nouveaux cas présumés
COVID19 - Nouveaux décès chez les AS (confirmés + présumés) \<= Tous les décès déclarés inférieur _à_ou_égal_à Le nombre de nouveaux décès parmi les AS (confirmés + présumés) doit être inférieur ou égal à Tous les décès déclarés Nouveaux décès parmi les AS (Confirmés + Présumés) Tous les décès déclarés
COVID19 - Nouveaux cas chez les AS (confirmés + présumés) \<= Tous les nouveaux cas inférieur _à_ou_égal_à Le nombre de nouveaux cas parmi les AS (confirmés + présumés) doit être inférieur ou égal à Tous les nouveaux cas Nouveaux cas parmi les AS (Confirmés + Présumés) Tous les nouveaux cas
COVID19 - Nouveaux décès parmi les AS (confirmés + présumés) \<= nouveaux cas parmi les AS (confirmés + présumés) inférieur _à_ou_égal_à Le nombre de nouveaux décès parmi les AS (confirmés + présumés) doit être inférieur ou égal aux nouveaux cas parmi les AS (confirmés + présumés) Nouveaux décès parmi les AS (Confirmés + Présumés) Nouveaux cas parmi les AS (Confirmés + Présumés)

Groupes d'utilisateurs

Le package de métadonnées englobe les groupes d’utilisateurs ci-après :

  1. Administrateur COVID19 -- réservé aux administrateurs système autorisés à modifier les métadonnées
  2. Saisie des données COVID19 -- destiné au personnel de saisie des données qui devraient pouvoir accéder et saisir des données
  3. Accès COVID19 -- destiné aux utilisateurs tels que les utilisateurs d'analyses qui devraient pouvoir visualiser les données, mais pas modifier les métadonnées.

Veuillez vous référer au guide d'installation pour en savoir plus.

Indicateurs

À partir des données saisies, nous pouvons calculer au moins les indicateurs suivants, parmi lesquels beaucoup sont recommandés par l'OMS pour les [ déclarations hebdomadaires ] (https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/331506/WHO-2019-nCoV-SurveillanceGuidance-2020.6-eng.pdf) et les présenter dans un tableau de bord. Tous les indicateurs du programme COVID-19 sont affectés au groupe d'indicateurs 'COVID19'.

nom description
COVID19 - Nouveaux décès confirmés Nombre de nouveaux décès confirmés
COVID19 - Nouveaux cas parmi les AS (Confirmés + Présumés) Nombre de Nouveaux cas parmi les AS (Confirmés + Présumés)
COVID19 - Proportion de AS parmi les cas déclarés (%) Proportion de AS parmi les cas déclarés (%)
COVID19 - Cas actifs Nombre de cas actifs
COVID19 - Cas clôturés Nombre de cas clôturés
COVID19 - Nouveaux cas confirmés Nombre de nouveaux cas confirmés
COVID19 - Taux de guérison (%) Taux de guérison des cas confirmés
COVID19 - Taux de létalité parmi les AS (%) Taux de létalité parmi les AS
COVID19 - Nouveaux cas hospitalisés Nouveaux cas hospitalisés
COVID19 - Testé Nombre total de tests effectués
COVID19 - Testé par PCR Testé par PCR
COVID19 - Taux de positivité (%) Taux de positivité
COVID19 - Nouveaux cas probables Nombre de nouveaux cas probables
COVID19 - Nouveaux cas de sortie d'hôpital Nombre de nouveaux cas de sortie d'hôpital
COVID19 - Nouveaux décès parmi les AS (Confirmés + Probables) Nombre de nouveaux décès parmi les AS (confirmés + probables)
COVID19 - Proportion de tests PCR (%) Proportion de tests PCR effectués
COVID19 - Tous les cas (confirmés + probables) Nombre de tous les cas (confirmés + probables)
COVID19 - Nouveaux décès probables Nombre de nouveaux décès probables
COVID19 - Taux de létalité (%) Taux de létalité parmi les cas confirmés

Tableaux de bord

Des éléments analytiques clés ont été configurés et ajoutés au tableau de bord "COVID19 - Surveillance hebdomadaire agrégée". Ces éléments comprennent des tableaux croisés dynamiques, des graphiques et une carte conçus pour fournir une visualisation des données pour certaines des données saisies sur la base des indicateurs. Au cours du processus d'adoption de ce package, les utilisateurs peuvent modifier ou créer des éléments supplémentaires en fonction de leurs besoins analytiques et également apporter les ajustements nécessaires au tableau de bord.

nom type
COVID19 - Tests, tests avec PCR et taux de positivité par niveau infranational cette année Tableau croisé dynamique
COVID19 - AS parmi les cas déclarés cette année Graphique
COVID19 - Taux de létalité chez les AS. Graphique
COVID19 - Nouveaux cas confirmés et décès au cours des 12 dernières semaines Graphique
COVID19 - Nombre cumulé de tests effectués, de cas déclarés, d'hospitalisations, de sorties et de décès Graphique
COVID19 - Nombre cumulé de cas confirmés par niveau infranational Carte
COVID19 - Décès par groupes d'âge au cours des dernières semaines Graphique
COVID19 - Cas confirmés par sexe au cours des 14 dernières semaines Graphique
COVID19 - Cas clôturés et actifs au niveau infranational au cours des derniers mois Graphique
COVID19 - Taux de guérison des cas et taux de létalité au cours des 12 dernières semaines Graphique
COVID19 - Cas actifs et clôturés au cours des 12 dernières semaines Graphique

Références