For the complete DHIS2 documentation index, see llms.txt.

Surveillance intégrée des maladies : Maladie fébrile aiguë - Document de conception du système¶

Introduction¶

Les systèmes de surveillance des maladies fébriles aiguës (MFA) aident les responsables de la santé publique à comprendre, détecter et répondre aux menaces de maladies infectieuses émergentes et réémergentes. La surveillance des MFA permet de mieux détecter les maladies infectieuses émergentes et susceptibles de provoquer des épidémies, qui peuvent être inconnues, sous-étudiées ou difficiles à suivre. De plus, les systèmes de surveillance peuvent soutenir les enquêtes hautement prioritaires en utilisant le personnel, le matériel, les fournitures, les réactifs et les processus de test disponibles [CDC, 2021] (https://www.cdc.gov/globalhealth/healthprotection/fieldupdates/2021/UFTF-AFI-Surveillance-COVID-Central-America.html#:~:text=AFI%20is%20characterized%20by%20a,bacteria%2C%20parasites%2C%20and%20fungi.). Développée en partenariat avec les Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC) des États-Unis, la boîte à outils de DHIS2 pour la surveillance des MFA aide les pays à numériser les activités de surveillance des MFA dans le système national, avec des fonctionnalités clés telles que l'établissement d'un lien entre les résultats de laboratoire et les cas de MFA dépistés et enrôlés qui se rendent dans les établissements de surveillance sentinelle. Dans le cadre d'une approche multi-pathogène de la surveillance des maladies, la conception du système MFA encourage la coordination entre les systèmes de surveillance des maladies, l'utilisation d'une base flexible et de ressources dédiées pour une détection efficace des maladies et des conclusions éclairées.

Le programme Tracker de DHIS2 intègre des versions numériques de deux formulaires génériques de la boîte à outils MFA : le formulaire de rapport sur les cas et le formulaire de prélèvement et d'analyse des échantillons, et les relie à un dossier de cas commun pour améliorer la gestion et l'analyse des données. Les métadonnées recommandées par les CDC sont utilisées pour la saisie électronique des données de surveillance des MFA individuelles/basées sur les cas, depuis le point de dépistage et d'enrôlement pour le compte de l'étude de surveillance. Le Tracker est conçu à des fins de surveillance selon les protocoles recommandés par les CDC pour la surveillance des MFA. Il n'est donc PAS optimisé ni destiné à soutenir la gestion individuelle des patients ou les soins qui leur sont prodigués. Des tableaux de bord préconfigurés permettent au personnel de santé publique des pays de suivre les résultats et les tendances des MFA en temps réel tant que les activités de surveillance se poursuivent.

Le document de conception du système explique comment le programme tracker a été configuré pour répondre aux exigences en matière de saisie et d'analyse des données et pour prendre en charge un flux de travail typique. Le document ne comprend pas une liste exhaustive de toutes les métadonnées saisies. De plus amples informations sur les aspects techniques du programme de lutte contre les MFA qui ont servi de base à la conception de ce système sont disponibles dans le protocole générique de la boîte à outils MFA. Ce protocole peut être obtenu en envoyant un courriel à l'adresse askgelsb@cdc.gov, avec une demande exprimant l'intérêt de recevoir la documentation pertinente.

Remerciements¶

La boîte à outils MFA a été développée en partenariat avec la Division de la protection de la santé mondiale (DGHP) du CDC, la Global Epidemiology, Laboratory, and Surveillance Branch (GELSB). La GELSB, en collaboration avec les bureaux nationaux et régionaux des CDC, joue un rôle actif dans l'harmonisation des efforts de surveillance des MFA dans le cadre d'une approche multi-pathogène de la surveillance des maladies et aide les pays à renforcer ces systèmes. Le Centre HISP remercie également le ministère de la santé de l'Ouganda, HISP Uganda et AFENET Liberia d'avoir partagé les leçons tirées de leur implémentation et leurs approches de la conception du système afin d'aider à l'élaboration de cette boîte à outils.

Contexte¶

Une maladie fébrile aiguë (MFA) est un syndrome clinique commun à une grande variété d'agents pathogènes, allant de maladies infectieuses traitables et évitables par la vaccination à de nouveaux agents pathogènes émergents à potentiel pandémique. Les MFA se caractérisent par l'apparition rapide de fièvre et d'autres symptômes tels que maux de tête, diarrhée, frissons et toux, et peuvent être causées par des virus, des bactéries, des parasites et des champignons. Les étiologies (causes) des MFA varient selon les régions et les saisons et peuvent évoluer dans le temps en fonction de facteurs tels que l'utilisation de vaccins, les changements environnementaux, l'assainissement et le développement économique. Compte tenu de la ressemblance entre les manifestations cliniques des MFA et la diversité des étiologies potentielles, le diagnostic devient un défi majeur dans les contextes où les capacités de diagnostic en laboratoire sont limitées. La collecte rapide et adéquate des données épidémiologiques et de laboratoire sur les MFA peut permettre d'identifier le fardeau et la répartition des maladies endémiques, les facteurs de risque d'infection et les inégalités en matière de santé qui sont méconnus. L'identification de ces facteurs contribue à la hiérarchisation des maladies ainsi qu'à la détection et à la réponse rapides aux épidémies potentielles.

Cas d’utilisation¶

En fonction du contexte national, les systèmes MFA peuvent être implémentés dans certains hôpitaux ou centres de santé pour une période limitée dans le temps ou pour des activités de surveillance continue. Le programme sert de registre électronique qui soutient la saisie électronique décentralisée des données de surveillance des cas jusqu'au niveau des établissements de santé et des laboratoires. Le programme MFA permet l'inscription, la saisie et le suivi des données sur les cas, depuis leur présentation à l'établissement jusqu'à la fin de leur parcours, y compris les résultats des analyses de laboratoire.

Ce package dédié à la surveillance des cas soutient une approche de la surveillance basée sur des indicateurs, qui se caractérise généralement par des informations structurées, communiquées aux responsables de la santé publique principalement par des sources formelles telles que les prestataires de soins de santé, selon un format normalisé ou un ensemble de définitions d'indicateurs (OMS, US CDC).

Déroulement¶

Le programme de lutte contre les MFA a été conçu pour refléter un flux de travail générique capable d'intégrer la saisie de données à la fois par l'établissement de santé (par exemple, les cliniciens et les infirmières) et par le laboratoire en utilisant le formulaire générique de déclaration des cas et le formulaire de prélèvement et d'analyse des échantillons de la boîte à outils MFA. Les questions et les options de réponse de ces formulaires génériques seront révisées par le pays implémenteur en fonction des objectifs de surveillance et du contexte spécifique au pays.

Configuration du programme¶

Le programme de lutte contre les MFA a été structuré en deux modules différents :

Le fait que les informations sur le dépistage soient collectées sous forme de données agrégées permet à l'implémenteur de gérer facilement un volume élevé de patients qui se présentent dans un service de dépistage, tout en garantissant la collecte d'un ensemble minimum d'éléments de données qui sont essentiels à l'élaboration d'indicateurs clés de performance.

Outre les données de dépistage, toutes les autres données sont collectées selon l'architecture de données ci-dessous :

Tableau 1 : Structure et description

Structure	Description
Inscription	À cette étape sont collectés les attributs de TEI basiques. Notez que certains attributs ont le préfixe 'GEN - '. Pour en savoir plus sur la Bibliothèque commune des métadonnées,référez-vous au lien fourni. Cette étape n'est pas répétable.
Rapport sur les cas	Cette étape permet de recueillir des informations de base sur les signes et les symptômes du patient, son exposition et les mesures préventives. Un seul événement de MFA peut être enregistré pour chaque TEI. En cas de nouvel MFA, même pour la même TEI, une nouvelle TEI doit être inscrite. L'étape n'est pas répétable.
Collecte et transport d'échantillons	Cette étape permet de recueillir des informations de base sur le prélèvement et le transport des échantillons. L'étape est répétable si plusieurs prélèvements/transports d'échantillons sont nécessaires pour chaque TEI.
Tests de laboratoire et résultats	Cette étape permet de recueillir des informations de base sur les tests effectués et les agents pathogènes identifiés. L'étape est répétable si plusieurs échantillons sont traités pour chaque TEI.
Suivi des patients et résultats	Cette étape permet de collecter des informations de base relatives au diagnostic. L'étape n'est pas répétable car il n'y a qu'un seul événement de MFA par TEI.

Remarque

Plusieurs éléments de données et ensembles d'options ont été maintenus comme génériques car ils dépendent fortement de l'implémentation et du pays concerné (plus de détails dans la section "Détails de l'étape") et peuvent être identifiés par le préfixe '[CONFIG]_'.

Utilisateurs cibles¶

Grâce à un processus de collaboration avec les pays implémenteurs et les acteurs de la surveillance à différents niveaux du système de santé, les utilisateurs potentiels d'une plateforme de saisie et de gestion des données de surveillance des MFA dans DHIS2 ont été identifiés :

Le personnel des établissements de santé ou les agents de surveillance : Le personnel de surveillance des MFA dans les sites de surveillance identifiés (hôpitaux, cliniques, etc.) sera responsable de la saisie des données sur les cas en fonction du cadre d'échantillonnage prédéterminé et des critères d'inclusion et d'exclusion.
Le personnel de santé publique : il contrôle et analyse les données de surveillance collectées à l'aide du système DHIS2 ; reçoit les alertes relatives aux flambées potentielles de cas d'une maladie générées par le système ; analyse les données de surveillance pour déterminer les tendances susceptibles d'indiquer des flambées potentielles de cas et planifie les activités de riposte le cas échéant.
Le personnel de laboratoire : il contrôle le suivi des échantillons ; peut être impliqué dans la saisie ou le téléchargement des résultats de laboratoire dans le dossier du patient.

Détails de l'ensemble de données / des étapes¶

Dépistage{ #screening }¶

L'ensemble de données s'est vu attribuer une périodicité quotidienne afin de permettre un suivi adéquat et optimal du principal indicateur clé de performance (ICP) lié à l'étape de dépistage. Toutefois, une évaluation et une personnalisation doivent être effectuées en fonction du contexte d'implémentation.

Structure du programme Tracker¶

Inscription¶

Lorsqu'un patient est inscrit au programme de lutte contre les MFA en tant qu'Instance d'Entité Suivie (TEI), les Attributs d'Entité Suivie (TEA) sont enregistrés pour former le profil du cas.

La Date d'inscription est utilisée comme la date de la première consultation du cas à l'OPD (Outpatient Department ou Service des patients externes) ou à l'IPD (Inpatient Department ou Service des patients internes) ; la date de saisie des données doit être indiquée dans la "Date du rapport " présente à chaque étape.

L'UID du patient n'a pas été renseigné car la codification dépend du pays ou de l'implémentation. L'UID du patient est un champ obligatoire qui sera unique pour chaque cas de MFA à inscrire. Vous trouverez [ici] (https://docs.dhis2.org/en/use/user-guides/dhis-core-version-238/configuring-the-system/programs.html#create_tracked_entity_attribute:~:text=Select%20Unique%20to,same%20organisation%20unit.) plus d'informations sur les attributs d'entités suivies générés automatiquement.

La date de naissance et l'âge peuvent être attribués de deux manières différentes :

Date de naissance connue : sélectionner la date de naissance.
Date de naissance inconnue : sélectionner l'option Date de naissance - Inconnue et saisir l'âge en années ou en mois.

Une fois cette opération effectuée, un âge de naissance "probable" est attribué à la date de naissance en fonction de la valeur saisie pour le TEA 'Années' ou 'Mois'.

Remarque

La date de naissance aura toujours une valeur car elle est utilisée dans le calcul des indicateurs du programme qui impliquent des tranches d'âge.

Les ensembles d'options assignés au TEA Race / Ethnie / Nationalité et Profession sont restés génériques car elles dépendent du contexte de leur utilisation. Elles doivent d'abord être personnalisées avant leur implémentation.

Rapport sur les cas{ #case-report }¶

Cette étape n'est pas répétable car une TEI ne peut se voir attribuer qu'un seul événement de MFA (voir Tableau 1).

À ce stade, une sélection multi-options d'éléments de données et d'ensembles d'options a été appliquée dans les sections :

Vaccins précédemment reçus
Exposition aux animaux
Environmental and other exposure
Historique de voyage

Étant donné que DHIS2 ne dispose pas encore d'une fonctionnalité de base de sélection multi-options, une adaptation a été effectuée comme suit :

Duplication des éléments de données éligibles pour un choix multi-options (le nombre de copies de l'élément de données doit être le même que le nombre d'options présentes dans l'ensemble d'options).
Règles du programme :
Masquer les éléments de données suivants si les précédents n'ont pas été sélectionnés
Afficher une erreur si la même option a été sélectionnée plus d'une fois dans le même groupe d'éléments de données

In the Environmental and other exposure section, three generic Other exposure data elements have been included and may be used as needed when completing the case CRF.

Collecte et transport des échantillons¶

Cette étape est répétable car plusieurs échantillons peuvent être collectés et envoyés à des moments différents.

Les informations de base relatives au prélèvement et au transport de l'échantillon (nom du préleveur et date/heure du prélèvement) et au type d'échantillon sont collectées à cette étape.

Tests de laboratoire et résultats¶

À cette étape, toutes les informations relatives au Test en laboratoire et au Pathogène testé sont restées génériques, car les tests dépendront du contexte de l'implémentation (les pathogènes et les tests sélectionnés pour les activités de liées aux MFA). Ces informations doivent être personnalisées avant l'implémentation.

La Date du test doit être indiquée pour chaque test. L'objectif est d'assigner l'événement du test à la bonne période dans les analyses, et d'aider à contrôler le délai entre les dates de réception et de résultat.

Suivi des patients et résultats{ #patient-follow-up-outcome }¶

Les Date de sortie et Date de sortie inconnue se réfèrent à l'hospitalisation et ne seront affichées que si l'hospitalisation a été sélectionnée dans la section Rapport de cas.

Les options Diagnostic sont restées génériques (à l'exception de Fièvre inexpliquée) et doivent être personnalisées avant leur implémentation.

Tableaux de bord et indicateurs¶

Tableaux de bord¶

Le programme comprend deux tableaux de bord distincts :

AFI.01 - Enquête sur les cas
AFI.02 - Vu d'ensemble sur la surveillance

[AFI.01 - Enquête sur les cas] (https://demos.dhis2.org/hmis/dhis-web-dashboard/#/o8Tqcwr8ZKe)¶

L'objectif principal du tableau de bord Enquête sur les cas est de surveiller et d'analyser en temps réel les données collectées sur les cas dans le cadre des efforts de surveillance des MFA. Les données d'inscription et les informations provenant du formulaire de rapport de cas et du formulaire de prélèvement et d'analyse des échantillons, telles que les données démographiques et les informations cliniques du patient, le prélèvement des échantillons et les résultats de laboratoire, sont affichées dans ce tableau de bord.

Tableau de bord de l'enquête sur les cas

[AFI.02 - Vue d'ensemble sur la surveillance] (https://demos.dhis2.org/hmis/dhis-web-dashboard/#/DwEJWGNY8ex)¶

L'objectif principal du tableau de bord Surveillance est de permettre à ceux qui mènent des activités de surveillance des MFA de contrôler et d'évaluer efficacement les données agrégées en temps réel qui sont collectées dans le cadre de ces activités. Les données de haut niveau sur le dépistage et l'inscription sont affichées ici, avec la possibilité de filtrer par établissement de santé pour un suivi plus approfondi des activités.

L'objectif de la visualisation "MFA - Qualité des données - Divergences dans les inscriptions" est de permettre de repérer les éventuelles incohérences entre les cas rapportés dans l'ensemble de données "Dépistage" (données agrégées) et le programme tracker "MFA - Maladies fébriles aiguës" (données individuelles) au niveau des établissements de santé.

L'indicateur utilisé, DQ - Divergences dans l'inscription, compare les cas inscrits déclarés dans les données agrégées et individuelles et, en cas d'incongruité, renvoie une valeur différente de 0 (formule utilisée : données agrégées ++MINUS++ données individuelles).

Indicateurs / Indicateurs de programme¶

Vous trouverez ci-dessous une liste des principaux indicateurs utilisés dans les visualisations, classés par thème :

Thème	Indicateurs
Suivi du programme	Patients dépistés Patients éligibles pour l'inscription Patients inscrits Patients non hospitalisés Patients hospitalisés
Caractéristiques des patients	Âge au moment de l'inscription (par tranche d'âge) Sexe
Signes et symptômes	Nombre moyen de jours écoulés entre l'apparition des symptômes et la présentation à l'établissement Symptômes Température moyenne
Exposition	Animal exposure Enviromental exposure Travel exposure
Laboratoire	Échantillon de sang et de sérum prélevé Échantillon de sang et de sérum accepté Acceptation de l'échantillon de sang et de sérum Test de laboratoire effectué
Détails des infections	Patients sans pathogène identifié Patients avec mono-infection Patients avec co-infections Pathogènes testés
Qualité des données	Divergences dans l'inscription

Groupes d'utilisateurs¶

Groupe d’utilisateurs	Tableau de bord	Métadonnées du programme	Données de programme
MFA - Accès	Lecture	Lecture seule	Lecture seule
MFA - Admin	Lecture et saisie	Lecture et saisie	Pas d'accès
MFA - Saisie des données	Pas d'accès	Lecture seule	Saisie et visualisation

Références¶

La boîte à outils MFA soutenue par les CDC peut être obtenue en envoyant un courriel à l'adresse askgelsb@cdc.gov, avec une demande exprimant l'intérêt de recevoir le matériel.

CDC (2022). Les CDC s'appuient sur le système de surveillance des maladies fébriles aiguës pour mener la riposte contre la COVID-19 https://www.cdc.gov/globalhealth/healthprotection/fieldupdates/2021/UFTF-AFI-Surveillance-COVID-Central-America.html#:~:text=AFI%20is%20characterized%20by%20a,bacteria%2C%20parasites%2C%20and%20fungi.

Bureau régional de l'OMS pour l'Afrique (2019). Directives techniques pour la surveillance intégrée des maladies et la riposte dans la Région OMS AFRO. Disponible sur : https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/325015/WHO-AF-WHE-CPI-05.2019-eng.pdf

US CDC (2021). Global Disease Detection Operations Center (Centre d'opérations mondiales de détection des maladies) : Aperçu. Disponible sur : https://www.cdc.gov/globalhealth/healthprotection/gddopscenter/how.html