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Données climatiques dans la planification des programmes de lutte contre le paludisme : considérations clés

Attribution : les recommandations ci-dessous ont été rédigées afin de soutenir un volet d'alerte précoce sur le climat et la santé du système d'information sur le paludisme du ministère mozambicain de la Santé, basé sur DHIS2 et développé en collaboration avec la Clinton Health Access Initiative (CHAI) et Saudigitus (HISP Mozambique).

Ce document vise à fournir des orientations aux professionnels de la santé publique, en particulier ceux qui travaillent pour ou avec des programmes de lutte contre le paludisme, en utilisant les données climatiques et météorologiques pour éclairer les décisions programmatiques en matière de lutte contre le paludisme et d'élimination de cette maladie. Les étapes ci-dessous sont des considérations clés que ces professionnels doivent prendre en compte ; bien qu'elles soient spécifiques au contexte du paludisme, ces étapes et considérations sont pertinentes pour les professionnels qui travaillent sur toutes les maladies sensibles au climat.

1. Élaborer des questions pertinentes pour l'élaboration des politiques

Il s'agit là de l'étape la plus importante. Si les questions et les travaux qui en découlent ne sont pas liés à des préoccupations politiques spécifiques, telles que des résultats particuliers en matière de santé, ou s'ils ne sont pas formulés de manière à ce que les résultats améliorent la prise de décision en matière de lutte contre le paludisme/d'élimination du paludisme, ces travaux ne seront qu'un simple exercice académique. Posez-vous la question « et alors ? » ; si vous ne pouvez pas y répondre facilement après l'analyse, alors vous ne devriez pas poursuivre, ou reformuler la question. Par exemple, le simple fait de vouloir examiner la relation entre la température ou les précipitations et les cas de paludisme n'améliorera pas la prise de décision programmatique. Envisagez plutôt d'utiliser la relation entre le climat et le paludisme pour identifier les zones où certaines interventions seront probablement plus ou moins efficaces. Voici quelques exemples clés :

a. Intégration des données climatiques dans l'adaptation au niveau infranational et dans les cartes des risques pour cibler les interventions

b. Durée moyenne de la saisonnalité pour le ciblage SMC

c. Début et durée de la saisonnalité pour le calendrier PID

d. Systèmes d'alerte précoce, ou SAP (uniquement s'ils sont liés à un plan d'intervention spécifique afin que les prévisions soient utilisées pour prendre des décisions programmatiques)

e. Emplacement idéal et types de réponses lors des urgences

2. De quelles données avez-vous besoin ?

Cela dépendra en grande partie des questions que vous vous posez. Il existe de nombreuses sources de données météorologiques et climatiques, ainsi que différents indicateurs pouvant être utilisés ; il peut être difficile de choisir lesquels utiliser. L'annexe 1 présente certaines sources de données et certains indicateurs courants, mais vous trouverez une source plus complète de données climatiques ici. Bien que ce document ne se veuille pas un guide exhaustif sur les données climatiques et sanitaires et leurs sources, il est important de comprendre certains points avant d'utiliser les données climatiques pour prendre des décisions.

a. Formations à l'utilisation des données. Une compréhension plus approfondie des données climatiques et de leurs sources peut s'avérer précieuse tant pour les analyses courantes que pour les analyses plus complexes que les pays pourraient souhaiter mener. Google Earth Engine propose de nombreux guides et tutoriels sur l'utilisation des données disponibles sur sa plateforme ici. De plus, dans le cadre de son programme ARSET, la NASA organise des formations gratuites sur l'utilisation des données de télédétection pour des applications sanitaires ; ce programme est vivement recommandé. Une grande partie de ces formations est également archivée.

b. Connaitre les forces et les faiblesses des données et des sources de données que vous comptez utiliser. La plupart des chercheurs et des professionnels choisissent entre les données satellitaires et les données des stations pour les indicateurs climatiques et météorologiques : les données des stations sont généralement considérées comme plus précises et comme la référence absolue, bien que leur disponibilité, leur couverture spatiale et temporelle et la variété des indicateurs soient souvent très limitées en Afrique. Les données satellitaires ne sont généralement pas aussi précises que les données des stations, mais elles sont gratuites et disponibles pour le monde entier, souvent avec une résolution de 1 km ou mieux, et remontant jusqu'à 1901. De plus, si les données de télédétection sont disponibles pour toutes les régions géographiques, leur résolution varie considérablement et ne sera jamais aussi précise pour un endroit spécifique que les données des stations. Les données de télédétection présentent des limites et des incertitudes qui ne sont pas toujours évidentes en soi. Elles peuvent également être sujettes à des lacunes dans les séries chronologiques et à des données manquantes qui peuvent avoir des implications importantes si elles ne sont pas traitées ou comblées. L'importance de ces limites et leur impact dépendent des données spécifiques utilisées et des fins auxquelles elles sont utilisées.

c. Connaitre vos options. Il existe un large éventail d'indicateurs développés à partir de données satellitaires, ce qui augmente le nombre de questions potentielles auxquelles ces données peuvent répondre, mais aussi la complexité du choix des indicateurs à utiliser. Par exemple, les estimations de température à partir de données satellitaires sont souvent disponibles sous forme de maximum, de minimum ou de différence entre les deux. Elles sont également généralement disponibles à un niveau horaire, quotidien, hebdomadaire, mensuel ou annuel, ce qui signifie que les chercheurs doivent également déterminer s'ils souhaitent utiliser une moyenne quotidienne, hebdomadaire ou mensuelle, un maximum quotidien, hebdomadaire ou mensuel, et/ou un minimum quotidien, hebdomadaire ou mensuel (ou la différence entre ces valeurs) ; la réponse dépend souvent de l'échelle des données sanitaires. Enfin, les valeurs absolues des indicateurs, par exemple la température et les précipitations, peuvent être peu informatives en raison des variations entre les pays et au sein d'un même pays. Si elles sont utilisées, ces valeurs absolues doivent donc être associées aux moyennes historiques et aux écarts par rapport à ces moyennes.

d. Prêter attention à la taille des données et aux exigences en matière de gestion des données. Les données climatiques et météorologiques, en particulier celles provenant de satellites, se présentent sous forme de fichiers volumineux qui nécessitent une bande passante Internet constante et puissante pour être téléchargées. Le stockage de ces fichiers peut nécessiter des serveurs locaux et/ou l'accès à des systèmes de stockage en nuage pour une utilisation cohérente dans les analyses décrites dans le présent document.

e. Compte tenu de cette complexité, il est recommandé aux chercheurs de commencer par effectuer une recherche documentaire sur les facteurs climatiques associés au paludisme dans le pays concerné et de s'en servir comme base pour déterminer quelles données sont appropriées pour leurs questions spécifiques, car en fin de compte, les données et les sources de données dont vous aurez besoin dépendront entièrement des questions que vous vous posez. Il est également utile de discuter avec un météorologue des analyses prévues afin qu'il puisse vous conseiller sur les données et les sources de données appropriées.

3. Données sur les maladies et problèmes liés à la qualité des données

Ce document part du principe que les chercheurs et les professionnels possèdent au moins des connaissances de base sur les données relatives aux maladies et sur la manière dont les différents types et sources de données peuvent influencer la qualité des données. Il convient toutefois de prendre en compte d'autres considérations concernant les données relatives aux maladies et leur relation avec les données climatiques et météorologiques :

a. La résolution temporelle et spatiale, comme pour les données climatiques et météorologiques, varie d'une source à l'autre. Ces résolutions doivent être harmonisées entre les données sur les maladies et celles sur le climat/la météo dans la mesure du possible. Par exemple, si seules les données mensuelles sur l'incidence des maladies sont disponibles, les données climatiques/météorologiques hebdomadaires doivent être agrégées ou moyennées au niveau mensuel afin de correspondre aux données sur l'incidence. De même, si les décisions programmatiques courantes sont prises au niveau du district/de l'État, les données sur les maladies et les données climatiques/météorologiques doivent également être agrégées ou moyennées à ce niveau.

b. Les maladies sensibles au climat, telles que le paludisme, sont influencées par de nombreux facteurs autres que le climat et les conditions météorologiques, et ces autres facteurs doivent également être pris en compte dans la mesure du possible lors des analyses évoquées dans le présent document. Ces autres facteurs doivent être pris en considération lors des recherches documentaires décrites à l'étape 2, mais comprennent souvent des facteurs tels que le calendrier et la couverture des interventions, l'utilisation et le changement des terres, ainsi que les données démographiques.

c. Il est également important de veiller à utiliser les données appropriées sur les cas de maladie ; parfois, les données sur l'incidence ou le nombre de nouvelles infections sont les plus appropriées pour établir une comparaison avec les données climatiques et sanitaires (comme c'est le cas pour P. viva ou pour les populations âgées de moins de 5 ans dans les zones plus endémiques), tandis que dans d'autres cas, les données sur la prévalence peuvent être plus appropriées. En fin de compte, cela dépendra des questions posées.

4. Contexte et analyses standardisées/de routine

Bien que les analyses spécifiques nécessaires dépendent des questions auxquelles il faut répondre, certaines étapes préliminaires doivent être franchies afin de faciliter les analyses et d'en accroître l'impact. À partir des résultats obtenus à l'étape 2 ci-dessus, envisagez les activités/analyses suivantes :

a. Énumérer les indicateurs clés, tant ceux qui sont précalculés que ceux qui doivent être calculés à partir d'autres indicateurs :

1. Température, valeurs absolues et anomalies (écart par rapport à la moyenne sur 20 ans)
      i. Minimum quotidien/hebdomadaire/mensuel
      ii. Maximum quotidien/hebdomadaire/mensuel
      iii. Amplitude thermique quotidienne/hebdomadaire/mensuelle
2. Précipitations
      i. Peuvent être quotidiennes/hebdomadaires/mensuelles moyennes ou totales
      ii. Envisager d'identifier des seuils biologiquement significatifs, sur la base des moyennes historiques ou des découvertes scientifiques
      iii. Jours au-dessus/en dessous de certains totaux de précipitations dans une semaine ou un mois
3. Humidité
      i. Spécifique, relative
4. Teneur en humidité du sol
      i. Teneur en réserve superficielle
      ii. Ruissellement de surface
      iii. Indice normalisé de précipitations-évapotranspiration
5. Événements climatiques violents tels que précipitations extrêmes, inondations, sécheresses, cyclones, etc.
 6. Évènements El Niño et La Niña, fréquence et impact.

b.  Décidez quels visuels et résultats issus des variables et analyses ci-dessus vous seront nécessaires pour répondre à vos questions. Si le pays utilise DHIS2 et CHAP, plusieurs visuels seront automatiquement générés. Voici quelques exemples supplémentaires : 1. Début, durée et intensité de la saison des pluies (et comment les calculer) 2. Cartes hebdomadaires/mensuelles des anomalies de température, de précipitations, d'humidité, d'humidité du sol (etc.) pour la stratification des risques 3. Événements climatiques violents tels que précipitations extrêmes, inondations, sécheresses, cyclones, etc.

c. Créer un profil climatologique pour le pays (si cela n'a pas déjà été fait ; voir ici, par exemple), à l'aide des indicateurs identifiés ci-dessus. Envisager également de collaborer avec le service météorologique afin de s'assurer que les données des stations locales sont incluses dans les profils climatologiques dans la mesure du possible, et comparées aux estimations des indicateurs clés dérivées des satellites. Ces profils climatologiques doivent comporter les éléments suivants : 1. Moyennes historiques (~ 20 ans) 2. Situation actuelle 3. Événements météorologiques et climatiques extrêmes au cours des 5 ou 10 dernières années ayant eu un impact sur la santé 4. Tendances récentes (~ 5 dernières années) 5. Changements futurs prévus i. À court terme (semaines à mois ; par exemple, Prévisions Climatiques Quotidiennes à Échelle Réduite de la NASA Earth Exchange) ii. À long terme (années à décennies ; prévisions du GIEC par exemple, à utiliser toutefois avec prudence compte tenu de l'incertitude des prévisions)

5. Créer des communautés de pratique (CoP)

Les communautés de pratique (CoP) mettent en avant les cas d'utilisation des données climatiques pour la santé auprès des principales agences et parties prenantes. Elles jouent un rôle important dans le développement d'une compréhension globale des analyses climatiques et sanitaires dans le pays, ce qui peut déboucher sur l'adoption de nouvelles idées et approches, l'amélioration de l'efficacité des travaux existants et la prévention des doublons. Elles peuvent en outre favoriser les collaborations entre des secteurs qui, sans cela, n'auraient peut-être pas interagi, tels que l'agriculture/la sécurité alimentaire et la santé. Ces communautés de pratique devraient inclure :

a. Agences de recherche

b. Départements de météorologie et d'environnement

c. Départements chargés des maladies sensibles au climat

d. Services des urgences

e. Les Partenaires qui travaillent dans les domaines susmentionnés

f. Parties prenantes issues des communautés touchées

6. Assurer le lien avec l'action

Assurez un suivi avec un soutien suffisant afin que les produits et les résultats des analyses soient réellement utilisés pour faciliter la prise de décision. En lien avec l'étape 1, il s'agit de l'une des étapes les plus cruciales pour garantir que les données soient traduites en actions et que les analyses ne restent pas un simple exercice théorique. Plus la question initiale est bien formulée, plus il sera facile de garantir que les résultats seront liés à des actions. Il est également important de veiller à ce qu'un cadre soit en place pour mettre en œuvre les résultats des analyses, tant en termes de ressources (financières et autres) que de gouvernance des rôles et des responsabilités pour l'action. Par exemple :

a. Intégration des systèmes d'alerte précoce dans le cadre plus vaste de l'EPR

b. Analyse régulière du calendrier du PID basée sur des calculs de saisonnalité

c. Utilisation d'indicateurs clés/d'anomalies pour la stratification des risques/l'adaptation au niveau infranational en vue d'interventions ciblées

7. Élaborer un plan de suivi et d'évaluation

Le plan de suivi et d'évaluation soutiendrait toutes les données et analyses climatiques utilisées pour la prise de décision. Cela est important pour améliorer encore la précision des analyses, car les indicateurs issus des estimations satellitaires peuvent varier en termes de précision d'un pays à l'autre, ce qui peut avoir une incidence sur l'efficacité des analyses pour lesquelles ils sont utilisés. Des plans de suivi et d'évaluation correctement élaborés peuvent également garantir que les résultats des analyses climatiques et sanitaires conduisent aux actions souhaitées et que ces actions ont l'impact souhaité.

a. Pour la plupart des analyses, le suivi et l'évaluation porteront principalement sur la mise en œuvre et l'impact des résultats qui utilisent les données relatives au climat et à la santé. Par exemple, l'évaluation de l'efficacité des systèmes d'alerte précoce reposera probablement principalement sur l'impact des mesures d'atténuation et d'intervention mises en œuvre sur la base des alertes émises par le système, plutôt que sur la précision des prévisions elles-mêmes (plus d'informations/conseils à suivre prochainement).

b. Les données disponibles provenant des stations climatiques et météorologiques permettent d'évaluer la précision des indicateurs dérivés des données de télédétection/satellitaires, car les données des stations sont généralement considérées comme la référence absolue. Cela constituerait également une excellente occasion de collaborer avec les services météorologiques afin d'évaluer et d'améliorer la quantité et la qualité des données des stations nationales en les comparant aux estimations dérivées des satellites.

8. Collaborer avec les observatoires nationaux de la santé

Si tel n'est pas encore le cas, envisager la création d'un observatoire national de la santé. Dans leur forme idéale, les observatoires de la santé ou les agences similaires ont pour mandat, de la part du gouvernement, d'accéder à toutes les données pertinentes relatives aux maladies sensibles au climat, ce qui facilite toutes les étapes ci-dessus (bien que cela soit plus pertinent d'un point de vue général sur les maladies que d'un point de vue spécifique au paludisme). Ces observatoires peuvent également servir de sources d'expertise sur les sources de données et les analyses appropriées, éliminant ainsi la nécessité d'établir et/ou de maintenir toutes les connaissances et l'expertise nécessaires pour effectuer ces analyses au sein d'un seul département chargé des maladies.

9. La gestion

Il s'agit d'un élément souvent négligé, mais important, qui doit toujours être pris en compte pour assurer la pérennité à long terme. Bien que cela soit plus pertinent pour les travaux indépendants des maladies, la mise en place d'une gouvernance pour les travaux sur le climat et la santé peut être essentielle pour créer des observatoires de la santé, établir l'interopérabilité des données et des normes de qualité, promouvoir les collaborations intersectorielles et garantir que les rôles/responsabilités, les procédures opérationnelles standard et le financement sont en place pour les actions basées sur les analyses du climat et de la santé.

Annexe 1. Liste des sources de données climatiques

Sources de données clés

Nom. Lien Type de données Langage du logiciel utilisé Format des données téléchargeables avantages Inconvénients
Google Earth Engine (GEE) Catalogue

Earth Engine
Divers : variables météorologiques historiques/actuelles, couverture terrestre, imagerie satellite, prévisions climatiques JavaScript, Python, REST Divers Accès à presque tous les indicateurs provenant de multiples sources/modèles Doit connaître l'une des langues prises en charge
Banque de données climatiques (CDS) Accueil

Ensembles de données
Divers, en particulier les produits de réanalyse ERA5 Python netCDF API plus facile à utiliser que GEE Fichiers volumineux
Centre sur les risques climatiques / CHIRPS Données Précipitation Aucun .tif, .png (compressé) Aucun logiciel spécial requis Il convient de télécharger chaque point temporel séparément ; la navigation sur le site peut prêter à confusion.
Unité de recherche sur le climat (CRU) Ensembles de données Température et autres Aucun .nc, .dat, .stn (compressé) Aucun logiciel spécial requis Il convient de télécharger chaque point temporel séparément ; la navigation sur le site peut prêter à confusion.
Données de température des stations GISS de la NASA Ensembles de données Température de surface (moyenne mensuelle) Aucun .txt, .csv Données réelles de la station Beaucoup de valeurs manquantes ; mauvaise couverture dans certaines régions.
Portail de connaissances sur le changement climatique de la Banque mondiale Portail Indicateurs prévisionnels selon les scénarios SSP futurs (modèles CMIP), certaines données historiques (CRU, ERA5) Aucun Excel, autres? Bonne source pour les données prévisionnelles et historiques Paramétrage limité du téléchargement

Indicateurs clés et meilleures sources

Indicateur Source(s) Options
Température ERA5, CRU (CDS, GEE, CRU) Moyenne quotidienne/hebdomadaire/mensuelle ; minimum et maximum quotidiens/hebdomadaires/mensuels ; amplitude thermique moyenne quotidienne/hebdomadaire/mensuelle
Précipitation CHIRPS, ERA5 (Centre des risques climatiques, CDS, GEE) Moyenne quotidienne/hebdomadaire/mensuelle ; Somme quotidienne/hebdomadaire/mensuelle ; jours au-dessus de 10/50/200 mm
Humidité ERA5, autres (CDS, GEE) Relative, spécifique
Teneur en humidité du sol ERA5, autres (CDS, GEE) De même, le ruissellement de surface et le contenu du réservoir cutané mesurent la propension à la formation d'eau stagnante.