WHO Anti-Tuberculosis Drugs Resistance Survey (DRS) - Tracker System Design¶

Shrnutí¶

Modul TB DRS v DHIS2 je nástroj pro sběr dat navržený speciálně pro průzkumy rezistence na léčiva (DRS) proti tuberkulóze (TB), což jsou diskrétní studie měřící rezistenci na léčivo u vybraného vzorku jedinců, kteří jsou zástupci celé populace s TBC. Průzkumy jsou prováděny pravidelně, dokud není vytvořena kapacita pro systém kontinuálního rutinního sledování. Modul TB DRS umožňuje zemím plně konfigurovat nástroj pro sběr dat z průzkumu, a to specifikací návrhu studie a laboratorního algoritmu používaného pro identifikaci a specializaci TBC a profilování fenotypové a/nebo genotypové rezistence na léky proti TBC. Modul je navržen pro použití týmy operativního průzkumu v centrálních prostorách Národního programu pro tuberkulózu (NTP) a/nebo v Národní referenční laboratoři(ích) (NRL). Periferní zdravotní péče a diagnostická zařízení účastnící se průzkumu mohou v případě potřeby přímo zadávat data z epidemiologických a klinických dotazníků od zapsaných účastníků. Výsledky laboratorních testů prováděných v zámoří, často přidělenou nadnárodní referenční laboratoří TB (SRL) nebo jiným podpůrným partnerem, mohou také zaměstnanci systému SRL přímo zadat do systému nebo je importovat pomocí souboru csv. Modul TB DRS není určen pro klinickou léčbu TBC. Modul umožňuje export standardizovaných souborů CSV připravených k analýze a obsahuje řídicí panely vizualizace dat, souhrny popisných dat a křížové tabulky a chybějící datové zprávy pro sledování kvality a průběhu průzkumu.

Purpose and Intended Audience¶

Tento dokument popisuje koncepční návrh, obsah a funkčnost standardního modulu DHIS2 TB DRS pro elektronické zachycování a vizualizaci dat z průzkumů odolnosti proti léčivům (DRS) proti TB. Modul byl navržen na základě nejnovějších pokynů a požadavků na metadata pro sledování rezistence na léky u TBC. Tento dokument je určen publiku odpovědnému za implementaci datových systémů TB a/nebo HMIS (Informační systémy pro správu zdraví) v zemích, jakož i těm, kteří mají konkrétně za úkol implementovat DRS následujícím způsobem:

1. Správci systému / kontaktní místa HMIS: osoby odpovědné za instalaci balíčků metadat, návrh a údržbu datových systémů HMIS a / nebo TB
2. Kontaktní místa koordinačních a operačních týmů DRS, složených ze zástupců národního programu pro tuberkulózu (NTP) a národní referenční laboratoře (NRL), odpovědných za dohled nad shromažďováním údajů, správou, analýzou a vykazováním funkcí průzkumu
3. Specialisté podpory implementace, např. ti, kteří poskytují technickou pomoc programu TB nebo základní jednotce HMIS na podporu a údržbu DHIS2 a souvisejících modulů, jako jsou skupiny HISP.

Dokument návrhu systému vysvětluje, jak byl modul DHIS2 TB DRS nakonfigurován tak, aby splňoval požadavky na zadávání dat a analýzu a podporoval typický pracovní postup. Dokument neobsahuje vyčerpávající seznam všech zachycených metadat. Tento dokument také nezohledňuje zdroje a infrastrukturu potřebnou k implementaci takového systému, jako jsou servery, napájení, připojení k internetu, zálohování, školení a podpora uživatelů. Další informace o technických aspektech programu TB informujících o návrhu tohoto systému jsou k dispozici v publikaci WHO o elektronickém záznamu a podávání zpráv o péči a kontrole tuberkulózy .

Pozadí¶

The Global Project on Anti-TB Drug Resistance Surveillance, hosted by WHO, is the oldest and largest project for the surveillance of antimicrobial drug resistance in the world. Since its launch in 1994, data on drug resistance in TB have been systematically collected and analysed from 169 countries worldwide (data until 2019). The data are derived from either continuous surveillance systems based on routine drug susceptibility testing (DST) in at least 80% of patients with bacteriologically confirmed TB or periodic epidemiological surveys of representative samples of patients. The Global Project is supported by various technical partners and the WHO Supranational TB Reference Laboratory (SRL) Network, which currently comprises 32 laboratories. The Global Project has served as a common platform for country, regional and global level evaluation of the magnitude and trends in anti-TB drug resistance and has assisted countries in planning the scale-up of the management of drug-resistant TB by providing essential data on national burden and drug resistance patterns. The three main categories used for global surveillance are rifampicin-resistant (RR) TB either with concurrent isoniazid resistance (MDR-TB) or without; isoniazid-resistant TB without concurrent rifampicin resistance (Hr-TB); and additional resistance to fluoroquinolones among these groups, which form a critical component of the recommended treatment regimens for both MDR/RR-TB and Hr-TB. Revised definitions for pre-extensively drug-resistant (pre-XDR) TB and XDR-TB are being applied from 2021. Pre-XDR-TB refers to combined resistance to rifampicin and a fluoroquinolone. XDR-TB refers to combined resistance to these drugs as well as resistance to at least one Group A drug recommended for the treatment of MDR/RR-TB (bedaquiline or linezolid).

Došlo ke značnému pokroku ve zvyšování pokrytí DST s globální expanzí nástrojů rychlé molekulární technologie, které umožnily rostoucímu počtu zemí přejít od spoléhání se na pravidelné průzkumy k vytváření systémů nepřetržitého sledování založených na rutinním DST. Navzdory tomuto pokroku se jedna třetina zemí stále spoléhá na provádění pravidelných průzkumů pro sledování rezistence na léčiva u TBC, z nichž 23 je v seznamu WHO 40 zemí s vysokou zátěží a/nebo vysokou odolností vůči více léčivům (MDR) -TB pro období 2016–2020. Provádění průzkumů může vybudovat a posílit celkovou laboratorní kapacitu, systémy pro přepravu vzorků a systémy doporučení a odborné znalosti v oblasti správy dat. Všechny tyto aspekty, stejně jako implementace systémů elektronického sběru dat a řešení datové konektivity, podporují země při přechodu na nepřetržité sledování TBC rezistentní na léky. Ta vede ke zlepšení přístupu k včasné a vhodné léčbě a péči a nabízí programové výhody, včetně rychlé detekce ohnisek, monitorování účinnosti intervencí v reálném čase a porozumění trendům.

„Pokyny WHO k zajištění správných postupů klinické a datové správy pro národní průzkumy TBC“ (2021) poskytují přehled procesů a postupů pro sběr, zpracování, čištění, validaci, analýzu a ukládání záznamů z průzkumů za účelem vytvoření vysoce kvalitních údajů z průzkumů, které jsou úplné, spolehlivé, včasné, správně zpracované a se zachovanou integritou. Za tímto účelem se všechny země vyzývají, aby přešly k zavádění elektronických systémů. Tento dokument popisuje plně přizpůsobitelný elektronický nástroj pro sběr dat pro anti-TB DRS navržený v souladu s normami a doporučeními uvedenými v „Pokynech WHO pro dohled nad rezistencí na léky při tuberkulóze, 6. vydání“ (2021). Nástroj průzkumu obsahuje dashboardy pro vizualizace a souhrny dat, včetně indikátorů kvality a pokroku, které usnadňují sledování a dohled nad aktivitami průzkumu. Uživatel nevyžaduje odborné znalosti v oblasti konfigurace a návrhu databáze. Implementace tohoto nástroje může zemím pomoci rozvíjet dovednosti v oblasti správy dat potřebné pro dlouhodobé zavádění elektronických systémů pro rutinní sledování TBC a TBC rezistentních na léky.

Přehled návrhu systému¶

Případ použití¶

Modul TB DRS umožňuje registraci případů TBC zapsaných do průzkumu a následné elektronické získávání dat a sledování laboratorních testů a výsledků testu citlivosti na léčivo (DST) u vzorků předložených z každého případu TBC do NRL, po počátečním bakteriologickém potvrzení TBC na zdravotnická zařízení evidující způsobilé případy. Modul zachycuje minimální soubor proměnných potřebných pro epidemiologickou analýzu údajů z průzkumu, jak je doporučeno v „Pokynech WHO pro dohled nad rezistencí na léky při tuberkulóze, 6. vydání“. Patří sem klinické a sociodemografické informace o pacientovi (včetně historie předchozí léčby proti TBC a volitelných doplňkových informací o potenciálních rizikových faktorech rezistence na léčiva při tuberkulóze), laboratorní testy provedené na každém vzorku předloženém k testování a laboratorní výsledky vybraných léky proti TBC. Modul TB DRS není určen k podpoře klinického managementu ani péče o pacienty. Modul slouží jako elektronický registr a databáze, obvykle podporující centralizovaný elektronický sběr dat v centrálních prostorách NTP a/nebo NRL. V závislosti na infrastruktuře země a dostupnosti zdrojů může být modul upraven tak, aby podporoval decentralizovaný elektronický sběr dat na úrovni zdravotnických zařízení. Části modulu jsou také nakonfigurovány tak, aby umožňovaly zadávání dat přímo pomocí SRL a dalších externích podpůrných partnerů.

The sampling strategy and the diagnostic algorithm of choice for an anti-TB DRS will vary depending on the country. A survey diagnostic algorithm often combines several phenotypic and/or molecular techniques for DST of a range of drugs selected by the country. The TB DRS module currently considers the two most common survey designs (either exhaustive sampling of all health facilities in the country or cluster sampling) and all the WHO-recommended laboratory diagnostic techniques for DST. Users can adapt the TB DRS module to fit their needs by selecting the survey design and the laboratory tests applicable to their survey. This includes configuration of the diagnostic test/s used at health facilities for the initial bacteriological confirmation of TB, and configuration of the numbers of sputum samples submitted to the NRL for further testing. Configuration of mixed survey designs in cases of stratified sampling are also possible. The specific anti-TB drugs to be included are also fully customisable.

Přehled programu¶

Pracovní postup průzkumu začíná registrací jednotlivce v zařízení periferního zdravotnictví po bakteriologickém potvrzení plicní TBC, což zahrnuje přiřazení jedinečného identifikátoru průzkumu (DRS ID) jednotlivci a vyplnění formuláře kazuistiky rozhovorem s pacientem a nahlédnutím do klinických záznamů. Formulář kazuistiky shromažďuje socio-demografické a klinické informace o případu, včetně stavu HIV, je-li to relevantní. Tyto informace jsou často shromažďovány na papíře spolu s mikroskopií nebo výsledky testů Xpert MTB/RIF počátečního bakteriologického potvrzení TBC. Z případu TB je poté odebrán alespoň jeden vzorek sputa pro pozdější přepravu do NRL. Podrobnosti o zásilce, jako jsou data odběru vzorků a odeslání, jsou rovněž uvedeny v příslušných papírových formulářích.

Vzorky jsou obvykle odesílány přímo do NRL a/nebo jiných spolupracujících laboratoří spolu se všemi papírovými formuláři, které byly vyplněny v periferním zdravotnickém zařízení. Určení referenti pro zadávání dat v centrálních prostorách NRL/NTP nejprve zaregistrují průzkum TB případu zadáním ID DRS do elektronické databáze spolu se základními detaily případu. Jakmile je případ zaregistrován, mohou být informace z papírových formulářů, jako je například formulář zprávy o případu, vloženy později. Po obdržení vzorků registrovaní pracovníci NRL zaregistrují vzorky v systému vyplněním údajů o zásilce, včetně data příjezdu vzorku, kromě dat odběru vzorků a odeslání uvedených v papírových formulářích. Vzhledem k tomu, že NRL provádí laboratorní analýzu vzorků, jsou do modulu zadávány také laboratorní testy a výsledky. Laboratorní testy a výsledky mohou pracovníci NRL zadávat přímo v reálném čase, nebo je mohou do systému zadávat pracovníci NTP nebo NRL z laboratorních registrů.

The TB DRS module is designed so that countries can configure the number of sputum samples to be collected from each enrolled TB case (between 1 and 4). Samples are automatically assigned a unique ID which corresponds to the concatenation of the patient (DRS) ID plus a sample replicate number. For each of the samples pre-configured in the system, the TB DRS module produces a form that contains the complete pre-defined list of tests to be conducted at NRL, for a customised panel of anti-TB drugs. The user should then enter, for each laboratory test, a final test result that corresponds to the specific sample tested (using the form of the sample which was used for testing). Interim results are not captured by the system at this stage . There is, however, the possibility that a test is conducted on more than one sample, such is the case for microscopy examination of sputum smears. The module is hence designed to track the laboratory history of each sample, beginning by specifying whether a sample was discarded or stored only, and allowing for the capture of free text comments. If samples are shipped to SRL, a form to collate shipment details as well as SRL results is created in the system, which can be completed at a later date.

Aby bylo možné zadat výsledky laboratorních testů, je nezbytným předpokladem, aby byl případ TB zaregistrován v modulu přidáním ID DRS a základních registračních údajů. Teprve poté lze související vzorky zaregistrovat pro elektronické zachycení laboratorních testů a výsledků. Jakmile je případ TB a vzorky zaregistrovány, lze data kufru a vzorku načíst pro úpravy a přidání dalších informací později. Přestože výše uvedený nejběžnější pracovní postup průzkumu byl popsán výše, modul může být přizpůsoben pro decentralizované nebo centralizované přímé zadávání dat v reálném čase bez použití nástrojů pro sběr dat v papírové podobě v zemích s odpovídající kapacitou a zdroji.

Fáze	Popis	Požadovaná předkonfigurace
Zápis	Zadejte sociálně-demografické údaje a zaregistrujte pacienta do modulu TB DRS	ID pacienta DRS ID klastru (pokud existuje)
Případová zpráva	Stav HIV, počáteční bakteriologické potvrzení TBC, anamnéza léčby poskytnutá pacientem, anamnéza léčby na základě klinických záznamů, konečné rozhodnutí o anamnéze léčby	Počáteční screening: Bakteriologické potvrzení TBC
Odběr a odeslání vzorků DRS do NRL	Ukázkové ID DRS, data sběru, aditiva, zásilka do NRL, příjezd do NRL, komentáře	Počet vzorků DRS odeslaných do NRL (konkrétní země)
NRL - DRS vzorek 1	Testy provedeny na vzorku 1 v NRL. Zachycuje testy, výsledky testů, data a komentáře	Počet fází programu (od 1 do 4) lze předem nakonfigurovat v závislosti na počtu vzorků odeslaných do NRL (specifické pro danou zemi)
NRL - DRS vzorek 2	Testy provedeny na vzorku 2 v NRL. Zachycuje testy, výsledky testů, data a komentáře	-//-
NRL - DRS vzorek 3	Testy provedeny na vzorku 3 v NRL. Zachycuje testy, výsledky testů, data a komentáře	-//-
NRL - DRS vzorek 4	Testy byly provedeny na vzorku 4 v NRL. Zachycuje testy, výsledky testů, data a komentáře	-//-
SRL	Zásilka vzorku do SRL a provedené testy. Zachycuje testy, výsledky testů, data a komentáře	Specifické pro danou zemi. Fázi SRL lze vyloučit ze seznamu fází programu

Zápis¶

Case Report Form¶

Návrh formuláře kazuistiky je založen na „příkladu klinického informačního formuláře“ z pokynů WHO pro sledování rezistence na léky při tuberkulóze, 6. vydání. Je nastaven jak pro zadávání sekundárních dat (na základě papírového formuláře), tak pro přímé zadávání dat během živého rozhovoru. Zachycuje:

• HIV stav pacienta;
• Initial screening results: bacteriological confirmation of TB either by sputum smear microscopy, Xpert MTB/RIF, or both tests. Initial screening test/s is/are configured during initial setup in the Maintenance App. NB If initial screening is based on microscopy examination of > 2 samples, only 2 samples with the highest bacterial load are entered.;
• Historie léčby poskytovaná pacientem (pokud si pacient nepamatuje dřívější léčbu TBC, jsou položeny kontrolní otázky);
• Historie léčby na základě lékařských záznamů;
• Konečné rozhodnutí o historii léčby;
• Jméno úředníka odpovědného za vyplnění formuláře.

Key data is displayed in the top bar of the DHIS2 DR-TB Case-based Surveillance Tracker Capture Interface. If the patient is already enrolled in the DR-TB Case Surveillance Tracker, relevant data such as TB Registration Number may be automatically imported into the TB DRS Module.

Collection and Shipment of DRS Samples to NRL¶

Počet vzorků odeslaných do NRL je definován v počáteční konfiguraci. Může se lišit od 1 do 4 (viz Počáteční konfigurace: Konstanty). Program je navržen tak, aby shromažďoval data o všech odeslaných vzorcích. Data pro každý vzorek se zadávají v odpovídající fázi programu. Formulář pro sběr a odeslání zachycuje data odběru vzorků, jakýchkoli aditiv, datum odeslání vzorku do NRL, datum příjezdu a všechny související komentáře a poznámky.

Doplňkové možnosti: žádné; CPC; Ethanol; PrimeStore; Jiný. Možnost „Jiné“ musí být uvedena v samostatném poli. ID vzorků DRS jsou generována podle následujícího standardu: ID pacienta DRS / [číslo vzorku] Čísla vzorků jsou 1,2,3 nebo 4.

Volitelná funkčnost: Pokud je modul použit pro přímé zadávání dat, lze oznámení zasílat národním referenčním laboratořím v případě, že v NRL probíhá sběr dat ve formě zpracování vzorků DRS v NRL. (bude konfigurováno samostatně).

NRL – DRS Samples 1 - 4¶

Fáze programu pro zpracování vzorků v NRL pro vzorky 1-4 jsou totožné. Každá fáze je určena k zachycení dat pro odpovídající vzorek.

Počet fází programu zobrazených v modulu TB DRS závisí na počtu vzorků, které jsou odeslány do NRL ke zpracování a jsou nastaveny v aplikaci Maintenance App při počáteční konfiguraci programu. Výchozí konfigurace jsou 2 vzorky.

NRL - DRS Ukázka 1 - 4 fáze programu se používají k zachycení klíčových dat souvisejících se zpracováním vzorku: použité testy, data a výsledky.

Každá země používá jiné testy na úrovni NRL. Modul TB DRS obsahuje následující testy:

• Mikroskopie stěru ze sputa
• Xpert MTB/RIF
• Xpert MTB/RIF Ultra
• Kultura v pevných médiích (např. LJ)
• Kultura v kapalných médiích (např. MGIT)
• Počáteční fenotypová DST v pevných médiích (např. LJ)
• Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích (např. MGIT)
• Následná fenotypová DST v pevných médiích (např. LJ)
• Následná fenotypová DST v kapalných médiích (např. MGIT)
• LPA (Rifampicin / Isoniazid)
• LPA (fluorochinolony / injekce druhé řady)
• Cílené sekvenování genů
• Sekvenování celého genomu

Testy používané ke zpracování vzorků národními referenčními kódy země jsou vybrány v aplikaci Údržba během počáteční konfigurace programu.

Program navíc zaznamenává, zda byl vzorek odmítnut nebo ztracen nebo zda byl uložen. Jakékoli důležité detaily, které nejsou zachyceny ve formuláři, lze zadat do sekce Komentáře a poznámky.

Sample Rejected or Lost¶

• Pokud je vzorek odmítnut nebo ztracen, musí být uvedeny důvody odmítnutí nebo ztráty. Fáze programu může být dokončena.

Sputum Smear Microscopy¶

• Datum a konečný výsledek mikroskopie jsou zachyceny. Možnosti konečného výsledku: Negativní; sporý; +; ++; +++

Xpert MTB/RIF¶

• Zaznamenáno datum a konečný výsledek Xpert MTB/RIF. Pokud je detekováno MTB, je zachycen kvantitativní výsledek.
• Možnosti Final Xpert MTB/RIF: MTB detekován (citlivý na rifampicin); Detekován MTB (odolný proti rifampicinu); Detekováno MTB (rifampicin neurčitý); MTB nebyl detekován; Žádný výsledek; Chyba; Neplatný
• Možnosti kvantitativního výsledku: Vysoká; Střední; Nízký; Velmi nízký; Stopa; Neznámý

Xpert MTB/RIF Ultra¶

• Zaznamenáno datum a konečný výsledek Xpert MTB/RIF Ultra. Pokud je detekováno MTB, je zachycen kvantitativní výsledek.
• Možnosti Final Xpert MTB/RIF Ultra: Detekováno MTB (citlivý na rifampicin); Detekován MTB (odolný proti rifampicinu); Detekováno MTB (rifampicin neurčitý); MTB nebyl detekován; Žádný výsledek; Chyba; Neplatný
• Možnosti kvantitativního výsledku: Vysoká; Střední; Nízký; Velmi nízký; Stopa; Neznámý

Culture in Solid Media (e.g. LJ)¶

• Je zaznamenáno datum očkování, konečný výsledek kultivace a datum konečného výsledku.
• Možnosti konečného výsledku kultury: MTB; NTM; Žádný růst; Kontaminovaný

Culture in Liquid Media (e.g. MGIT)¶

• Je zaznamenáno datum očkování, konečný výsledek kultivace a datum konečného výsledku.
• Možnosti konečného výsledku kultury: MTB; NTM; Žádný růst; Kontaminovaný

Initial Phenotypic DST in Solid Media (e.g. LJ)¶

• Je zaznamenáno datum očkování, datum konečných výsledků a konečné výsledky pro testovaná léčiva.
• Seznam léků pro testování je definován v aplikaci Maintenance App během počátečního nastavení programu.

• Seznam léčiv dostupných k testování: rifampicin, izoniazid CC, izoniazid CB, pyrazinamid, etambutol, levofloxacin, moxifloxacin CC, moxifloxacin CB, amikacin, bedaquilin, delamanid, linezolid, clofazimin
• Clofamizin a pyrazinamid lze testovat pouze pomocí tekutých médií.
• CC znamená Kritické koncentrace doporučené WHO pro testování izoniazidu a moxifloxacinu.
• CB znamená Clinical Breakpoint a odpovídá testování vyšších koncentrací pouze pro izoniazid a moxifloxacin.
• Možnosti konečného výsledku: Citlivé; Odolný; Kontaminovaný; Neurčitý

Initial Phenotypic DST in Liquid Media (e.g. MGIT)¶

• Je zaznamenáno datum očkování, datum konečných výsledků a konečné výsledky pro testovaná léčiva.
• Seznam léků pro testování je definován v aplikaci Maintenance App během počátečního nastavení programu.

• Seznam léčiv dostupných k testování: rifampicin, izoniazid CC, izoniazid CB, pyrazinamid, etambutol, levofloxacin, moxifloxacin CC, moxifloxacin CB, amikacin, bedaquilin, delamanid, linezolid, clofazimin
• CC znamená Kritické koncentrace doporučené WHO pro testování izoniazidu a moxifloxacinu.
• CB znamená Clinical Breakpoint a odpovídá testování vyšších koncentrací pouze pro izoniazid a moxifloxacin.
• Možnosti konečného výsledku: Citlivé; Odolný; Kontaminovaný; Neurčitý

Subsequent Phenotypic DST in Solid Media (e.g. LJ)¶

• Je zaznamenáno datum očkování, datum konečných výsledků a konečné výsledky pro testovaná léčiva.
• Seznam léků pro testování je definován v aplikaci Maintenance App během počátečního nastavení programu.

• Seznam léčiv dostupných k testování: rifampicin, izoniazid CC, izoniazid CB, pyrazinamid, etambutol, levofloxacin, moxifloxacin CC, moxifloxacin CB, amikacin, bedaquilin, delamanid, linezolid, clofazimin
• Clofamizin a pyrazinamid lze testovat pouze pomocí tekutých médií.
• CC znamená Kritické koncentrace doporučené WHO pro testování izoniazidu a moxifloxacinu.
• CB znamená Clinical Breakpoint a odpovídá testování vyšších koncentrací pouze pro izoniazid a moxifloxacin.
• Možnosti konečného výsledku: Citlivé; Odolný; Kontaminovaný; Neurčitý

Subsequent Phenotypic DST in Liquid Media (e.g. MGIT)¶

• Je zaznamenáno datum očkování, datum konečných výsledků a konečné výsledky pro testovaná léčiva.
• Seznam léků pro testování je definován v aplikaci Maintenance App během počátečního nastavení programu.

• Seznam léčiv dostupných k testování: rifampicin, izoniazid CC, izoniazid CB, pyrazinamid, etambutol, levofloxacin, moxifloxacin CC, moxifloxacin CB, amikacin, bedaquilin, delamanid, linezolid, clofazimin
• CC znamená Kritické koncentrace doporučené WHO pro testování izoniazidu a moxifloxacinu.
• CB znamená Clinical Breakpoint a odpovídá testování vyšších koncentrací pouze pro izoniazid a moxifloxacin.
• Možnosti konečného výsledku: Citlivé; Odolný; Kontaminovaný; Neurčitý

LPA (Rifampicin / Isoniazid)¶

• Je zachyceno datum LPA, typ vzorku a konečné výsledky pro rifampicin a izoniazid (pokud je detekován MTBc).
• Možnosti typu vzorku: Vzorky sputa nebo sedimenty; Izoláty MTB kultury
• Možnosti konečného výsledku: Citlivé; Odolný; Neurčitý

LPA (Fluoroquinolones / Second-line Injectables)¶

• Je zachyceno datum LPA, typ vzorku a konečné výsledky pro fluorochinolony, kanamycin, amikacin/kapreomycin a etambutol (pokud je detekován MTBc).
• Ethambutol lze z počátečního nastavení z formuláře vyloučit.
• Možnosti typu vzorku: Vzorky sputa nebo sedimenty; Izoláty MTB kultury
• Možnosti konečného výsledku: Citlivé; Odolný; Neurčitý

Targeted Gene Sequencing¶

• Je zaznamenáno datum výsledků, výsledky genotypové speciace a profilování genotypové rezistence pro testovaná léčiva (pokud byl detekován komplex MTB (MTBc) a je k dispozici interpretovatelné profilování genetické rezistence).
• Výsledky genotypové speciace: MTBc; Smíšené MTBc a jiné; NTM; Kontaminace; Selhalo
• V případě, že je vybráno „Selhalo“, musí být uvedeny důvody selhání.
• Seznam léků dostupných pro profilování genotypové rezistence: rifampicin, izoniazid, pyrazinamid, etambutol, fluorochinolony, amikacin, etionamid, becquilin, delamanid, linezolid, clofazimin, pretomanid
• Možnosti konečného výsledku: Odolný; Citlivý; Žádný interpretovatelný výsledek (tj. Nedostatečná kvalita); Neurčité (tj. Mutace neznámá / nezařazená)

Whole Genome Sequencing¶

• Je zaznamenáno datum výsledků, výsledky genotypové speciace a profilování genotypové rezistence pro testovaná léčiva (pokud byl detekován komplex MTB (MTBc) a je k dispozici interpretovatelné profilování genetické rezistence).
• Výsledky genotypové speciace: MTBc; Smíšené MTBc a jiné; NTM; Kontaminace; Selhalo V případě, že je vybráno "Selhalo", musí být uvedeny důvody selhání.
• Seznam léků dostupných pro profilování genotypové rezistence: rifampicin, izoniazid, pyrazinamid, etambutol, fluorochinolony, amikacin, etionamid, becquilin, delamanid, linezolid, clofazimin, pretomanid
• Možnosti konečného výsledku: Odolný; Citlivý; Žádný interpretovatelný výsledek (tj. Nedostatečná kvalita); Neurčité (tj. Mutace neznámá / nezařazená)

Storage Only¶

• Pokud je vzorek uložen, je zaškrtnuto políčko „Pouze úložiště“. Fáze programu může být dokončena.

Comments and Remarks¶

SRL¶

Tuto fázi programu lze přidat do formulářů pro zadávání údajů, pokud jsou vzorky během průzkumu odeslány do laboratoře SRL.

Initial Configuration¶

Patient DRS ID¶

Možnosti zadávání dat pro ID pacienta DRS: Pro vyčerpávající vzorkování všech zdravotnických zařízení se ID pacienta DRS generuje pomocí předdefinovaného 3písmenného kódu zařízení a sériového čísla k identifikaci pacienta (formátováno na 3 číslice)

• CAD/001
• CAD/002
• Etc.

Pro vzorkování klastru se do vygenerovaného ID DRS pacienta přidá ID klastru, což je samostatný atribut sledované entity. Atribut ve fázi registrace stále sestává z kódu zařízení a sériového čísla. Všechna ID vzorků DRS jsou generována pomocí předdefinovaného třípísmenného kódu zařízení, ID klastru (formátováno na 3 číslice) a sériového čísla k identifikaci pacienta (formátováno na 3 číslice)

• CAD/002/001
• CAD/002/002
• Etc.

Konstanty¶

Modul TB DRS obsahuje různé funkce, které umožňují zemím snadno převzít jeho funkce a konfigurovat je pomocí národních norem a požadavků. Počáteční konfigurace konstant umožňuje takové přizpůsobení. Seznam konfigurovatelných nastavení a příručka jsou uvedeny níže:

Cluster Sampling / Exhaustive Sampling of all Health Facilities¶

Nakonfigurujte, zda země používá klastrový odběr nebo vyčerpávající odběr všech zdravotnických zařízení

Konstantní	Nastavení	UID
Vzorkování klastru	Hodnota "1" = Zahrnout vzorkování klastru pro DRS. Hodnota "0" = vyloučit vzorkování klastru z DRS.	aYPQMlxAZsz

Number of DRS Samples sent to NRL¶

Konfigurujte počet vzorků odesílaných do zpracování NRL

Konstantní	Nastavení	UID
Vzorek 2 pro zpracování v NRL	Hodnota "1" = Přidat DRS Vzorek 2 shromážděné pro zpracování NRL do konfigurace programu Hodnota "0" = Odebrat DRS Vzorek 2 z konfigurace programu	rSS2dY6gwLJ
Vzorek 3 pro zpracování v NRL	Value "1" = Add DRS Sample 3 collected for NRL processing to program configuration Value "0" = Remove DRS Sample 3 from program configuration	sqgp1l0s4wp
Vzorek 4 pro zpracování v NRL	Value "1" = Add DRS Sample 4 collected for NRL processing to program configuration Value "0" = Remove DRS Sample 4 from program configuration	NXr7RH56Q1R

Initial Screening Tests¶

Konfigurujte, které počáteční screeningové testy se používají pro bakteriologické potvrzení TBC: Sputum Smear Microscopy, Xpert MTB/RIF nebo oba.

Konstantní	Nastavení	UID
Bakteriologické potvrzení TBC	Value "1" = Include both "Sputum Smear Microscopy" and "Xpert MTB/RIF" for Bacteriological Confirmation of TB. Value "2" = Include only "Sputum smear microscopy" for Bacteriological Confirmation of TB. Value "3" = Include only "Xpert MTB/RIF" for Bacteriological Confirmation of TB.	gYj2CUoep4O

SRL Sample Processing¶

Konfigurujte, zda má země možnost zasílání vzorků do SRL (nadnárodní laboratoř).

Konstantní	Nastavení	UID
SRL	Value "1" = include an option of sending Samples to SRL Value "0" = exclude an option of sending Samples to SRL	AUltNkQXzdm

Tests at NRL¶

Konstantní	Nastavení	UID
Mikroskopie stěru sputa	Value "1" = include Sputum Smear Microscopy in the list of tests. Value "0" = exclude Sputum Smear Microscopy from the list of tests.	q1ah12sKfG3
Kultura v pevných médiích (např.LJ)	Value "1" = include Culture in Solid Media (e.g. LG) in the list of tests. Value "0" = exclude Culture in Solid Media (e.g. LG) from the list of tests.	iSKEqcuVAui
Kultura v kapalném médiu (např. MGIT)	Value "1" = include Culture in Liquid Media (e.g. MGIT) in the list of tests. Value "0" = exclude Culture in Liquid Media (e.g. MGIT) from the list of tests.	qpAseG5vJyS
Xpert MTB/RIF	Value "1" = include Xpert MTB/RIF in the list of tests. Value "0" = exclude Xpert MTB/RIF from the list of tests.	H4ObQDbhnTA
Xpert MTB/RIF Ultra	Value "1" = include Xpert MTB/RIF Ultra in the list of tests. Value "0" = exclude Xpert MTB/RIF Ultra from the list of tests.	cFoFDkXKcXC
Počáteční fenotypová DST v Solid Media (např. LJ)	Value "1" = include Initial Phenotypic DST in Solid Media (eg. LJ) in the list of tests. Value "0" = exclude Initial Phenotypic DST in Solid Media (eg. LJ) from the list of tests.	HjN2Bgnusyy
Počáteční fenotypová DST v tekutých médiích (např. MGIT)	Value "1" = include Initial Phenotypic DST in Liquid Media (eg. MGIT) in the list of tests. Value "0" = exclude Initial Phenotypic DST in Liquid Media (eg. MGIT) from the list of tests.	OQxeAIyQUeB
Následná fenotypová DST v pevných médiích (např. LJ)	Value "1" = include Subsequent Phenotypic DST in Solid Media (eg. LJ) in the list of tests. Value "0" = exclude Subsequent Phenotypic DST in Solid Media (eg. LJ) from the list of tests.	BpRfvWQcvTo
LPA (Rif/Inh)	Hodnota "1" = zahrnout LPA (Rif/Inh) do seznamu testů. Hodnota "0" = vyloučit LPA (Rif/Inh) ze seznamu testů.	ESUffSPwmju
LPA (Fq/2LI)	Value "1" = include LPA (Fq/2LI) in the list of tests. Value "0" = exclude LPA (Fq/2LI) from the list of tests.	govArZqiFzY
Následná fenotypová DST v kapalných médiích (např. MGIT)	Value "1" = include Subsequent Phenotypic DST in Liquid Media (eg. MGIT) in the list of tests. Value "0" = exclude Subsequent Phenotypic DST in Liquid Media (eg. MGIT) from the list of tests.	W8Fm1pJuJPL
Cílené sekvenování genů	Hodnota "1" = zahrnout cílené sekvenování genů do seznamu testů. Hodnota "0" = vyloučit Targeted Gene Sequencing ze seznamu testů.	KkypNdLNW1f
Sekvenování celého genomu	Value "1" = include WGS in the list of tests. Value "0" = exclude WGS from the list of tests.	MC7QUDr9YKC

List of Available Drugs¶

Počáteční fenotypová DST v Solid Media (např. LJ)
Konstantní	Nastavení	UID
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - rifampicin	Value "1" = include Rifampicin in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Rifampicin from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	Q67DDsupq7v
Počáteční fenotypová DST v Solid Media - Isoniazid (CC)	Value "1" = include Isoniazid (CC) in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Isoniazid (CC) from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	dAPAScvFPfX
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - Isoniazid (CB)	Value "1" = include Isoniazid (CB) in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Isoniazid (CB) from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	anpSc1tmlft
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - pyrazinamid	Value "1" = include Pyrazinamide in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Pyrazinamide from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Pyrazinamide can only be tested using liquid media.	aCaNdqUIDZl
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - Ethambutol	Value "1" = include Ethambutol in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Ethambutol from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	yxPHZFwMTN6
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - levofloxacin	Value "1" = include Levofloxacin in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Levofloxacin from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	NlOX3oV4gWe
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - moxifloxacin (CC)	Value "1" = include Moxifloxacin (CC) in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Moxifloxacin (CC) from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	RJNE1o9cw7Y
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - moxifloxacin (CB)	Value "1" = include Moxifloxacin (CB) in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Moxifloxacin (CB) from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	m4c79OHEKCG
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - Amikacin	Value "1" = include Amikacin in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Amikacin from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	XO1V9o5C95J
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - Bedaquiline	Value "1" = include Bedaquiline in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Bedaquiline from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	UxcTzMRQsfa
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - Delamanid	Value "1" = include Delamanid in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Delamanid from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	VUlsMrm4D8k
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - Linezolid	Value "1" = include Linezolid in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Linezolid from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media.	CVQR2ZtZWxk
Počáteční fenotypová DST v pevných médiích - Clofazimine	Value "1" = include Clofazimine in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Clofazimine from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in solid media. Clofazimine can only be tested using liquid media.	ZDpLleSK08x

Počáteční fenotypová DST v tekutých médiích (např. MGIT)
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - rifampicin	Value "1" = include Rifampicin in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Rifampicin from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	uOJYEwV7XfN
Počáteční fenotypová DST v Liquid Media - Isoniazid (CC)	Value "1" = include Isoniazid (CC) in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Isoniazid (CC) from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	cRldkiBh5xv
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - Isoniazid (CB)	Value "1" = include Isoniazid (CB) in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Isoniazid (CB) from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	lqaf0KfpHGd
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - pyrazinamid	Hodnota "1" = zahrnout pyrazinamid do seznamu léků dostupných pro počáteční fenotypové testování DST v kapalných médiích. Hodnota "0" = vyloučit pyrazinamid ze seznamu léků dostupných pro počáteční fenotypové testování DST v kapalných médiích.	FDtk4otxDse
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - Ethambutol	Value "1" = include Ethambutol in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Ethambutol from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	n9zOOsLO0QP
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - levofloxacin	Value "1" = include Levofloxacin in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Levofloxacin from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	t7Okdm8VgDV
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - moxifloxacin (CC)	Value "1" = include Moxifloxacin (CC) in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Moxifloxacin (CC) from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	dgjpdQO2Iva
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - moxifloxacin (CB)	Value "1" = include Moxifloxacin (CB) in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Moxifloxacin (CB) from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	UL61U78GWCg
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - Amikacin	Value "1" = include Amikacin in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Amikacin from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	x6v8O6EZo0U
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - Bedaquiline	Value "1" = include Bedaquiline in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Bedaquiline from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	KjvwSybuWJU
Počáteční fenotypová DST v kapalnách médiích - Delamanid	Value "1" = include Delamanid in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Delamanid from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	BJTzi3WWjhT
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - Linezolid	Value "1" = include Linezolid in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Linezolid from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	aZq11UuXPP6
Počáteční fenotypová DST v kapalných médiích - Clofazimine	Value "1" = include Clofazimine in the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Clofazimine from the list of drugs available for Initial Phenotypic DST testing in liquid media.	GL5JTtBvbEC

Následná fenotypová DST v pevných médiích (např. LJ)
Konstantní	Nastavení	UID
Následná fenotypová DST v pevných médiích - rifampicin	Value "1" = include Rifampicin in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Rifampicin from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media.	zJoEjvstp2d
Následná fenotypová DST v pevných médiích - Isoniazid (CC)	Value "1" = include Isoniazid (CC) in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Isoniazid (CC) from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media.	eM3UfUO7W8O
Následná fenotypová DST v pevných médiích - Isoniazid (CB)	Value "1" = include Isoniazid (CB) in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Isoniazid (CB) from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media.	s8WPR943gGS
Následná fenotypová DST v pevných médiích - pyrazinamid	Value "1" = include Pyrazinamide in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Pyrazinamide from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Pyrazinamide can only be tested using liquid media.	bHPYGfrFNV2
Následná fenotypová DST v pevných médiích - Ethambutol	Value "1" = include Ethambutol in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Ethambutol from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media.	wNxsAieLWYc
Následná fenotypová DST v pevných médiích - levofloxacin	Value "1" = include Levofloxacin in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Levofloxacin from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media.	Fw8wOlTETPt
Následná fenotypová DST v pevných médiích - moxifloxacin (CC)	Hodnota "1" = zahrnout moxifloxacin (CC) do seznamu léků dostupných pro následné testování fenotypového DST v pevných médiích. Hodnota "0" = vyloučit moxifloxacin (CC) ze seznamu léků dostupných pro následné testování fenotypového DST v pevných médiích.	Czx5FuOqF9i
Následná fenotypová DST v pevných médiích - moxifloxacin (CB)	Value "1" = include Moxifloxacin (CB) in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Moxifloxacin (CB) from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media.	NvA1K4hFJbc
Následná fenotypová DST v pevných médiích - amikacin	Value "1" = include Amikacin in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Amikacin from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media.	dTwKm1u2VhY
Následná fenotypová DST v Solid Media - Bedaquiline	Value "1" = include Bedaquiline in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Bedaquiline from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media.	r70ONQRhaHY
Následná fenotypová DST v Solid Media - Delamanid	Value "1" = include Delamanid in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Delamanid from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media.	RFqmLP5W5di
Následná fenotypová DST v pevných médiích - Linezolid	Value "1" = include Linezolid in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Linezolid from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media.	KIeI2d8xalG
Následná fenotypová DST v pevných médiích - Clofazimine	Value "1" = include Clofazimine in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Value "0" = exclude Clofazimine from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in solid media. Clofazimine can only be tested using liquid media.	bywBn5DxVdi

Následná fenotypová DST v kapalných médiích (např. MGIT)
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - rifampicin	Value "1" = include Rifampicin in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Rifampicin from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	lelJEADYpeI
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - izoniazid (CC)	Value "1" = include Isoniazid (CC) in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Isoniazid (CC) from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	ZBpqH7xJLBO
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - Isoniazid (CB)	Value "1" = include Isoniazid (CB) in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Isoniazid (CB) from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	F9DTb5zl8rS
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - pyrazinamid	Value "1" = include Pyrazinamide in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Pyrazinamide from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	VY15auehssY
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - Ethambutol	Hodnota "1" = zahrnout Ethambutol do seznamu léků dostupných pro následné testování fenotypového DST v kapalných médiích. Hodnota "0" = vyloučit Ethambutol ze seznamu léků dostupných pro následné fenotypové testování DST v kapalných médiích.	Ic5asMdbpH8
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - levofloxacin	Value "1" = include Levofloxacin in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Levofloxacin from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	b1KgVOel21P
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - moxifloxacin (CC)	Value "1" = include Moxifloxacin (CC) in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Moxifloxacin (CC) from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	HhKitGif8RV
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - moxifloxacin (CB)	Value "1" = include Moxifloxacin (CB) in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Moxifloxacin (CB) from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	xfltmyqC3p0
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - amikacin	Value "1" = include Amikacin in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Amikacin from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	a4PpEfSutcV
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - bekaquilin	Value "1" = include Bedaquiline in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Bedaquiline from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	QaioqMbO0TX
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - Delamanid	Value "1" = include Delamanid in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Delamanid from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	Xt5GU9kBD7q
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - Linezolid	Value "1" = include Linezolid in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Linezolid from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	mU5iEABeF2K
Následná fenotypová DST v kapalných médiích - Clofazimine	Value "1" = include Clofazimine in the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media. Value "0" = exclude Clofazimine from the list of drugs available for Subsequent Phenotypic DST testing in liquid media.	Nb6oHqjCCZq

LPA (fluorochinolony / injekce druhé řady)
LPA (Fq/2Li) - Ethambutol	Value "1" = include Ethambutol Result in LPA (Fq/2LI) Test. Value "0" = exclude Ethambutol Result from LPA (Fq/2LI) Test.	AiyTLOJHMkl

Widget horní lišty¶

Widget horní lišty v aplikaci Tracker Capture je užitečný pro uživatele zadávajícího data, aby měl přehled o informacích o TEI (případ) při každém otevření registrace TEI pro tento program.

Níže uvedená tabulka shrnuje programové indikátory a proměnné zobrazené ve widgetu horní lišty a způsob jejich výpočtu. „Typ“ označuje, zda je konkrétní proměnná konfigurována jako indikátor programu s povolenou možností „zobrazit ve formuláři“, nebo zda je vypočítána a zobrazena pomocí pravidel programu.

Proměnná	Typ	Výpočet
Aktuální věk (roky)	Indikátor programu	Počet let mezi aktuálním datem a atributem sledované entity „Datum narození (věk)“.
Historie léčby	Pravidlo programu	Historie předchozí léčby na základě formuláře hlášení případu (nové / dříve ošetřené)
Rezistence (Rif, Inh, Fq)	Pravidlo programu	Uvádí léky, u kterých byla detekována a zaznamenána rezistence na léčiva ve stupních NRL - DRS, vzorky 1-4

Validation¶

Formuláře pro zadávání dat obsahují několik kontrol ověření data. Tyto zahrnují:

• Datum statusu HIV nemůže být před datem narození
• Datum zahájení předchozí léčby nemůže být před datem narození
• Data výsledků testů pro kulturu a DST nemohou být před daty očkování
• Datumy testů nemohou předcházet datům odběru vzorků
• Datum odeslání vzorku nemůže předcházet datu odběru vzorku
• Datum příjezdu vzorku nemůže předcházet datu odeslání

Lze nastavit další kontroly ověření.

Widget zpětné vazby¶

Následující zpětnovazební zprávy jsou nakonfigurovány tak, aby se zobrazovaly v Widgetu zpětné vazby, pokud jsou splněny určité podmínky, jak je uvedeno v tabulce níže:

Zpráva	Stav
Laboratorní výsledek jste zadali před datem odběru vzorku. Datum laboratorních výsledků musí být v den odběru vzorku nebo po něm. Zkontrolujte prosím oba termíny.	Chyba: Datum laboratorního výsledku předchází datu odběru vzorku
Před datem očkování jste zadali laboratorní výsledek. Datum laboratorních výsledků musí být v den očkování nebo po něm. Zkontrolujte prosím oba termíny.	Chyba: Datum laboratorního výsledku předchází datu očkování
Odpověď „Ano“ byla přiřazena automaticky. Pacient je buď již registrován k léčbě TBC a / nebo potvrdil předchozí léčbu TBC.	Varování: Stav předchozí historie léčby je automaticky přiřazen na základě odpovědí ve formuláři hlášení případů
Pokud je počáteční screening založen na mikroskopickém vyšetření > 2 vzorků, přidejte pouze 2 vzorky s nejvyšší bakteriální zátěží.	Varování: Uživatel může přidat pouze screeningová data pouze ze dvou vzorků

Analytics and Indicators¶

Tato část popisuje ovládací panely a analytiku, které byly nakonfigurovány pro uživatele analytiky.

Balíček je dodáván s následující sadou indikátorů a ovládacích panelů:

• DRS - 01. Zápis
• Kumulativní údaje o zápisu a údaje o zápisu za posledních 12 měsíců
  • Celkem zapsaných pacientů
  • Zapsaní noví pacienti
  • Zapsaní dříve léčení pacienti
  • Zapsaní pacienti s neznámou anamnézou léčby
  • Zapsaní pacienti podle zařízení
• DRS - 02. Chybějící datová zpráva:
• Chybějící datová zpráva ukazující ze všech zařazených pacientů, kolik výsledků chybí pro klasifikaci historie konečné léčby, věk, pohlaví a HIV
• Missing data line list
• DRS - 03. Transport vzorků, laboratorní zpracování a výsledky testů (obecné)
• Cyklus pro transport a zpracování vzorků
  • Dny od odběru vzorku po příjezd vzorku do NTRL
  • Cyklus vzorků - kumulativní procentuální tabulka
  • Průměrný počet dní od odběru vzorku do příjezdu vzorku do NTRL
• Laboratorní výsledky
  • Procento odmítnutých vzorků při příjezdu do NTRL
  • Pokrok ve zpracování vzorků pro všechny dostupné testy
• DRS - 04. Mikroskopie
• Vzorky a pacienti s výsledkem mikroskopie
• Výsledky mikroskopie na pacienta
• DRS - 05. Xpert MTB/RIF
• Doba obratu pro zpracování vzorku
• Vzorky a pacienti testovaní pomocí Xpert MTB/RIF
• Pacienti s více vzorky testovanými pomocí Xpert MTB/RIF
• Detekce MTB
• Rezistence na rifampicin
• Výsledky testů na vzorek
• DRS - 06. Xpert MTB/RIF Ultra
• Doba obratu pro zpracování vzorku
• Vzorky a pacienti testováni pomocí Xpert MTB/RIF Ultra
• Pacienti s více vzorky testovanými Xpert MTB/RIF Ultra
• Detekce MTB
• Rezistence na rifampicin
• Výsledky testů na vzorek
• DRS - 07. Kultura v pevných médiích (např. LJ)
• Doba obratu pro zpracování vzorku
• Testovány vzorky a pacienti
• Pacienti s více vzorky testovanými s kulturou v pevném médiu
• Výsledky testů na pacienta
• Výsledky testů na vzorek
• DRS - 08. Kultura v kapalných médiích (např. MGIT)
• Doba obratu pro zpracování vzorku
• Testovány vzorky a pacienti
• Pacienti s více vzorky testovanými s kulturou v kapalných médiích
• Výsledky testů na pacienta
• Výsledky testů na vzorek
• DRS - 09. Počáteční DST v pevných médiích (např. LJ)
• Testovány vzorky a pacienti
• Pacienti s více vzorky testovanými podle Počáteční DST v pevných médiích
• Výsledky testů na pacienta
• Výsledky testů na vzorek
• DRS - 10. Počáteční DST v kapalných médiích (např. MGIT)
• Testovány vzorky a pacienti
• Pacienti s více vzorky testovanými podle Počáteční DST v kapalných médiích
• Výsledky testů na pacienta
• Výsledky testů na vzorek
• DRS - 11. Následné DST v pevných médiích (např. LJ)
• Testovány vzorky a pacienti
• Pacienti s více vzorky testovanými následným DST v pevných médiích
• Výsledky testů na pacienta
• Výsledky testů na vzorek
• DRS - 12. Následné DST v kapalných médiích (např. MGIT)
• Testovány vzorky a pacienti
• Pacienti s více vzorky testovanými následným DST v kapalných médiích
• Výsledky testů na pacienta
• Výsledky testů na vzorek
• DRS - 13. LPA (Rif/Inh)
• Doba obratu pro zpracování vzorku
• Testovány vzorky a pacienti
• Pacienti s více vzorky testovanými pomocí LPA (Rif/Inh)
• Detekce MTB
• Výsledky testů na pacienta
• Výsledky testů na vzorek
• DRS - 14. LPA (Fq/2LI)
• Doba obratu pro zpracování vzorku
• Testovány vzorky a pacienti
• Pacienti s více vzorky testovanými pomocí LPA (Fq/2LI)
• Detekce MTB
• Výsledky testů na pacienta
• Výsledky testů na vzorek
• DRS - 15. Mapy
• Pacienti s RR-TB (podle zdravotnického zařízení)
• Pacienti s isoniazidovou rezistencí a na rifampicin citlivou TBC (podle zdravotnického zařízení)
• Pacienti s RR-TB rezistentní na Fq (podle zdravotnického zařízení)

Pokud země nepoužívá určité testy ze seznamu na národních referenčních úrovních, lze příslušné ovládací panely odebrat.

Skupiny uživatelů¶

V modulu TB DRS jsou zahrnuty následující skupiny uživatelů:

• DRS - Admin: může upravovat / zobrazovat metadata; žádný přístup k datům [všechny fáze programu]
• DRS - Sběr dat: dokáže zobrazit metadata, dokáže zachytit data [všechny fáze programu]
• DRS - Přístup: může zobrazit metadata, může zobrazit data [všechny fáze programu]

Reference¶

• Pokyny pro zajištění dobrých klinických a správních postupů pro národní průzkumy TBC. Ženeva: Světová zdravotnická organizace; 2021.
• Pokyny pro sledování rezistence na léčiva při tuberkulóze - šesté vydání. Ženeva: Světová zdravotnická organizace; 2021.